综合计算工时超过法定工作时间的部分，不付加班费而强制调休是否合法，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一、综合计算工时工作制下的加班费与调休规定

在综合计算工时工作制下，劳动者的总实际工作时间超过总法定标准工作时间的部分，应视为延长工作时间，并支付不低于工资150%的加班费。对于法定休假日工作的，则需按不低于工资300%的标准支付加班费。这意味着，在综合计算工时工作制下，仅通过调休来替代加班费的做法，在法定休假日加班的情况下是不合法的。

二、不同加班时间下的合法性分析

1. 延长工作时间（非法定休假日）：

   • 在综合计算周期内，如果劳动者的总实际工作时间超过了总法定标准工作时间，这部分超出的时间应视为延长工作时间。
   • 对于这部分延长的工作时间，用人单位应支付不低于工资150%的加班费。如果用人单位选择通过调休来替代加班费，这种做法在法律上并没有明确禁止，但通常建议用人单位与劳动者协商一致。

2. 法定休假日工作：

   • 在法定休假日安排劳动者工作的，用人单位必须支付不低于工资300%的加班费。
   • 这种情况下，用人单位不能通过调休来替代加班费，因为法定休假日的加班费是法律明确规定的，具有强制性。

三、劳动者的维权途径

如果用人单位在综合计算工时工作制下，对于超过法定工作时间的部分不支付加班费而强制调休，且这种调休不符合法律规定（如法定休假日工作），劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：

   • 劳动者可以首先尝试与用人单位进行协商，要求用人单位按照法律规定支付相应的加班费。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权责令用人单位限期支付加班费，并可能对用人单位进行处罚。

3. 申请劳动仲裁：

   • 劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，劳动者需要提供相关的证据，如考勤记录、加班通知等，以证明自己的加班事实和用人单位未支付加班费的情况。

4. 提起诉讼：

   • 如果对仲裁结果不服，劳动者还可以依法向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

温馨提示：在处理此类问题时，建议劳动者保留好相关的证据材料，如考勤记录、加班通知、工资条等，以便在需要时提供证明。同时，如果劳动者对法律程序不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以寻求专业律师的帮助。您有任何法律问题，都可以直接向我咨询。