两年治疗期过后解除劳动合同，是否有赔偿需根据具体情况判断。以下是对此问题的全面分析：

1. 违法辞退的情况：

   • 若用人单位在劳动者医疗期满后，无正当理由解除劳动合同，且该解除行为违反了《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定（如未提前通知、未支付经济补偿等），则视为违法辞退。
   • 赔偿标准：根据《劳动合同法》第四十八条和第八十七条，劳动者有权要求用人单位支付赔偿金，赔偿金为经济补偿标准的二倍。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

2. 合法辞退的情况：

   • 若劳动者医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，且用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后解除劳动合同，则属于合法辞退。
   • 经济补偿：在此情况下，用人单位需支付经济补偿，计算方式与违法辞退中的经济补偿相同。

3. 医疗补助金：

   • 除经济补偿外，根据一些地方性法规或企业规章制度，劳动者在医疗期满后被辞退时，可能还有权获得一定的医疗补助金。具体能否获得及补助金的数额，需参照当地相关法规或企业规定。

4. 特殊情形下的辞退无需赔偿：

   • 若劳动者在医疗期内存在《劳动合同法》第三十九条规定的过错情形，如严重违反用人单位规章制度、被依法追究刑事责任等，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿或赔偿。

法律建议：

• 劳动者在遭遇治疗期过后被解除劳动合同时，应及时收集相关证据（如劳动合同、工资条、辞退通知、医疗证明等），以证明自己的权益受到侵害。
• 劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。在申请劳动仲裁时，需提交仲裁申请书、证据材料等，并按照仲裁程序进行。

可能法律后果：

• 若用人单位违法辞退劳动者，可能面临支付赔偿金、经济补偿以及可能的行政处罚等法律后果。
• 若劳动者未及时维权或证据不足，可能导致无法获得应有的赔偿或补偿。

综上所述，两年治疗期过后解除劳动合同是否有赔偿，需根据辞退的合法性及具体情形确定。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合适的法律手段维护自身利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。