当您在劳动仲裁中胜诉后，公司选择上诉并在一审中提交了许多证据，这确实是一个需要您积极应对的情况。以下是一些详细且有针对性的建议，帮助您更好地处理这一问题：

一、了解上诉缘由与依据

首先，您需要仔细研究公司提交的上诉状，明确公司上诉的具体缘由和依据。这有助于您针对性地准备反驳策略，理解公司可能提出的新的主张或证据。

二、准备仲裁裁决书及相关证据

1. 仲裁裁决书：这是您胜诉的重要依据，务必妥善保管并准备多份复印件，以备不时之需。
2. 相关证据：回顾仲裁阶段已提交的有效证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作邮件等，这些证据在诉讼中同样具有证明力。同时，考虑是否需要补充新的证据，如能证明您工作情况、公司违规行为等的材料。

三、递交答辩状

根据上诉程序规定的时间，您需要递交答辩状。在答辩状中，您应针对公司的上诉理由逐一进行反驳和辩解，阐明原仲裁裁决的合法性与合理性。答辩状应条理清晰、逻辑严密，以充分维护您的合法权益。

四、积极配合法院工作

1. 按时参加庭审：庭审是诉讼过程中的重要环节，您应按时参加，并遵守法庭纪律。
2. 清晰陈述观点：在庭审中，您应清晰、有条理地陈述自己的观点和理由，积极回应公司的诉求。
3. 质证与辩论：抓住关键时机进行质证和辩论，对公司的证据进行逐一分析，指出其不合理或不合法的部分。

五、考虑寻求法律帮助

如果您对法律程序或证据准备感到迷茫或不确定，可以考虑寻求专业的法律帮助。律师可以为您提供专业的法律意见，协助您准备证据材料，并在庭审中为您辩护。

六、保持冷静与耐心

面对公司的上诉，您需要保持冷静和耐心。上诉并不意味着结果会改变，而且仲裁裁决在大部分情况下仍具有一定的执行效力。密切关注上诉进展，准备好相关证据以备不时之需。

七、了解执行效力

即使公司上诉，仲裁裁决在大部分情况下仍具有一定的执行效力。如果公司未在规定时间内履行裁决义务，您可以向法院申请强制执行。

总之，面对公司的上诉，您需要积极应对、充分准备，并密切关注上诉进展。通过合理利用法律资源、清晰陈述观点、积极回应公司诉求，您有望在诉讼中维护自己的合法权益。