公司内部承包收取的风险保证金是否合法，需分情况讨论：
一、合法情形
基于合法有效的合同约定：
- 如果公司内部承包合同中明确约定了风险保证金的收取，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种收取行为是合法的。例如，在一些高风险行业或项目中，为了保障项目的顺利进行和应对可能的风险，合同中约定承包方缴纳一定比例的风险保证金作为履约保障，这是被允许的。
符合行业惯例或特定业务需求：
- 在某些特定行业或业务领域，收取风险保证金可能是一种行业惯例或特定业务需求。只要这种惯例或需求不违反法律法规，且双方在合同中明确约定，那么收取风险保证金也是合法的。
二、不合法情形
未与员工或承包方达成明确的合同约定：
- 如果公司未与员工或承包方就风险保证金的收取达成明确的合同约定，或者合同中的相关条款存在模糊、歧义或违反法律法规的情况，那么这种收取行为就是不合法的。例如，公司单方面要求员工或承包方缴纳风险保证金，但未在合同中明确约定或约定不明确，就可能构成违法。
违反法律法规的禁止性规定：
- 如果公司收取风险保证金的行为违反了法律法规的禁止性规定，如利用收取风险保证金之名进行非法集资、挪用资金等违法行为，那么这种收取行为就是严重不合法的，可能会面临法律责任。根据《劳动合同法》第九条的规定，用人单位招用劳动者，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。虽然这一条款主要针对的是劳动者与用人单位之间的关系，但同样可以类比到公司内部承包的情境中，即公司不得以不合理的名义向承包方收取财物。
三、法律建议与维权途径
对于公司而言：
- 应严格遵守法律法规和合同约定，避免收取任何形式的非法保证金或押金。如果需要收取风险保证金，应在合同中明确约定，并确保该约定合法有效。
- 可以通过完善绩效考核激励制度等合法方式，将工资绩效与员工或承包方的业绩挂钩，而不是直接将经营风险转嫁给对方。
对于员工或承包方而言：
- 如果遇到公司要求缴纳风险保证金的情况，有权拒绝并要求公司说明合法依据。
- 如果已经缴纳了风险保证金，可以与公司协商要求退还。协商不成的，可以向相关监管部门（如劳动监察部门）投诉，由监管部门责令公司限期退还；也可以通过法律途径（如劳动仲裁或诉讼）依法维护自身合法权益。
总结来看，公司内部承包收取的风险保证金是否合法，取决于具体的法律规定和合同约定。公司应严格遵守相关法律法规，避免非法收取风险保证金；员工或承包方也应积极维护自己的合法权益，遇到不合理要求时及时寻求法律帮助。如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。