工程项目分包收保证金是否合法，需根据具体情况判断，在符合法律规定和双方自愿协商的前提下是合法的，但若存在不合规情形则不合法。以下是对这一问题的详细分析：
合法情形
法律依据与双方自愿协商：
- 根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》和《建设工程质量保证金管理办法》，招标人或发包人有权在招标文件或合同中要求投标人或承包人提交保证金，用于保障合同履行和工程质量。这种要求应基于双方的自愿协商，并在合同中明确约定。
- 例子：在一份建设工程分包合同中，发包方与承包方明确约定了保证金条款，包括保证金的金额、用途、退还条件等，且该金额未超过法律法规规定的比例上限。这种情况下，收取保证金是合法的。
合理金额与专用性：
- 保证金金额应符合法律法规规定的比例上限，如投标保证金不得超过招标项目估算价的2%，质量保证金通常为工程价款结算总额的3%左右。
- 保证金应专款专用，仅用于保障合同履行和工程质量，不得挪作他用。
不合法情形
缺乏明确合同约定或法律依据：
- 若发包方未在招标文件或合同中事先说明需要缴纳保证金，或在施工过程中突然提出此要求，且无法提供法律依据，承包方有权拒绝。
- 例子：发包方在分包合同签订后，未经承包方同意，单方面要求承包方缴纳高额保证金，且无法提供相关法律法规依据。这种情况下，收取保证金是不合法的。
收取高额保证金：
- 如保证金金额远超法律法规规定的比例上限，则此类高额收取行为可能构成不合法。
- 例子：投标保证金超过了招标项目估算价的2%，或者质量保证金远超过了工程价款结算总额的3%。这些情况下，高额收取保证金是不合法的。
违规挪用保证金：
- 发包方收取保证金后，必须按约定用途使用。如挪作他用，将侵犯承包方权益，构成违法行为。
- 例子：发包方将收取的保证金用于其他非合同约定的项目，如支付其他工程的款项或用于公司运营等。这种情况下，违规挪用保证金是不合法的。
未及时退还保证金：
- 在合同履行完毕且无质量问题后，发包方应及时退还保证金。若无故拖延或拒不退还，同样构成不合法行为。
- 例子：合同约定的缺陷责任期已满，且承包方已履行完所有合同义务，但发包方以各种理由拖延退还保证金。这种情况下，未及时退还保证金是不合法的。
应对措施与建议
- 加强沟通：承包方在面对保证金要求时，应与发包方充分沟通，确保其合法性并明确约定相关条款。
- 审查合同：在签订合同时，应仔细审查保证金条款，确保其符合法律法规要求。特别注意保证金金额、用途、退还条件等关键条款。
- 依法维权：如对保证金收取存在疑问或认为其不合法，承包方可向建设行政主管部门等相关监管部门咨询或举报，也可通过法律途径维护自身权益。
综上所述，工程项目分包收保证金是否合法需根据具体情况判断。在符合法律规定和双方自愿协商的前提下，交纳保证金是合法的；但若存在不合规情形，承包方应依法维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。