针对您提出的“公司因旷工两天罚款是否合法”的问题，我们需要从多个法律角度和实际情况进行综合分析。

首先，从法律层面来看：

1. 《中华人民共和国劳动法》的相关规定：

   • 该法第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有明确的法律依据，否则公司不能随意扣除员工的工资。

2. 《工资支付暂行规定》的解读：

   • 根据该规定第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求赔偿，并从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则需按最低工资标准支付。这一规定限制了公司扣除工资的幅度，确保了劳动者的基本生活需求。

接下来，我们分析公司因旷工两天罚款的具体情况：

• 旷工的性质：旷工是劳动者无正当理由未按规定提供劳动的行为，公司有权对此进行管理和惩戒。然而，惩戒的方式和幅度必须合法、合理。

• 罚款的合法性：直接因旷工两天而罚款，且罚款金额超出劳动者当天应得工资的部分，很可能违反了《工资支付暂行规定》中关于不得克扣劳动者工资的规定。除非公司能证明旷工行为确实给其造成了相当于罚款金额的经济损失，并且这种损失是合理且可量化的，否则罚款行为通常是不合法的。

• 规章制度的考量：如果公司有合法、合理且经过员工同意或认可的规章制度，并在其中明确规定了旷工的处罚措施，那么这种处罚可能是被允许的。但即便如此，处罚措施也必须符合法律法规的规定，不能随意设定高额罚款。

综合以上分析，我们可以得出以下结论：

• 一般情况下不合法：公司因旷工两天而直接罚款，且罚款金额超出劳动者当天应得工资的部分，在大多数情况下是不合法的。

• 特殊情况需证明：如果公司能证明旷工行为确实给其造成了相当于罚款金额的经济损失，并且这种损失是合理且可量化的，同时规章制度也符合法律法规的规定，那么在某些特定情况下，罚款可能是被允许的。但这种情况较为罕见，且需要公司承担举证责任。

建议：

• 如果您认为公司的罚款行为不合法，首先可以与公司进行协商，要求其按照法律规定支付工资。
• 若协商不成，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
• 在处理此类问题时，建议您咨询专业的法律人士，以确保自己的权益得到充分保障。