员工擅自离岗，用人单位一般不能直接罚钱，但可根据具体情况要求员工承担相应责任。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与基本原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工擅自离岗可能构成严重违反用人单位规章制度的行为。然而，直接罚钱并非法律规定的处理方式。用人单位在处理此类问题时，应遵循合法、公平、公正的原则，确保处理措施与员工违规行为的性质和情节相匹配，且不得违反法律法规的强制性规定。
二、可能的处理方式及责任承担
依据规章制度处理：
- 用人单位可依据合法制定的规章制度对擅自离岗的员工进行处理。这些规章制度需经民主程序制定并向员工公示才具有法律效力。
- 常见处罚包括警告、口头批评、绩效扣分、调岗降薪等，但一般不包括直接罚钱。若规章制度中明确规定了擅自离岗的违约责任（如扣除绩效奖金等），且该责任合理且不得显失公平，用人单位可依据合同约定进行处理。
- 罚款额度需符合地区限制，且扣除后工资不得低于最低工资标准。调岗降薪也需具有合理性，并与员工工作能力、表现相匹配。
赔偿损失：
- 若员工擅自离岗给用人单位造成实际经济损失，如招聘费用、生产经营损失等，用人单位可依据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，要求员工进行赔偿。
- 赔偿金额应根据实际损失情况计算，并通过法律途径判定。在扣除赔偿时，每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
解除劳动合同：
- 若员工擅自离岗行为严重违反用人单位规章制度，或给用人单位造成重大损害，用人单位可依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，解除与员工的劳动合同，且无需支付经济补偿。
三、注意事项与建议
确保规章制度合法有效：
- 用人单位应确保规章制度经民主程序制定、向员工公示，并符合法律法规的强制性规定。否则，以此为依据进行的处理可能被认定为违法。
合理确定赔偿金额：
- 用人单位在要求员工赔偿损失时，应合理确定赔偿金额，并确保赔偿要求具有法律依据和事实依据。避免过度索赔或不当处理。
加强员工管理：
- 用人单位应加强员工管理，完善内部规章制度，明确员工离职流程和责任。通过培训、沟通等方式，提高员工对规章制度和离职流程的认识和遵守意识，以预防类似情况的发生。
举例说明：假设某员工未经许可擅自离岗，导致公司生产线停工一天，造成直接经济损失5000元。公司可依据规章制度对员工进行警告处理，并要求员工赔偿实际损失5000元（需通过法律途径判定）。若员工拒绝赔偿或赔偿金额无法达成一致，公司可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
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