公司规定在吸烟区吸烟的时间是否合法，需结合具体情况判断，但核心原则是该规定不得违反法律法规的强制性规定，也不得侵犯员工的合法权益。以下从不同角度进行分析：

1. 从劳动法角度看

• 工作时间与休息时间：根据《劳动法》及相关规定，员工享有合理的休息时间。公司若规定在吸烟区吸烟的时间，应确保该时间不计入工作时间，且不影响员工正常的休息权益。若公司强制要求员工在特定时间段内（如工作时间内）去吸烟区吸烟，并因此扣减工资或视为旷工，则可能违法。
• 规章制度合法性：公司规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论），并公示或告知员工。若关于吸烟时间的规定未经此程序，或内容显失公平（如限制过严），则可能因程序或内容违法而被认定无效。

2. 从安全生产与健康角度看

• 吸烟区设置合理性：公司设置吸烟区需符合消防安全要求，且不得影响非吸烟员工的健康。若吸烟区设置不当（如通风不良、距离工作区过近），可能违反《安全生产法》或《公共场所卫生管理条例》。
• 吸烟时间限制：公司可规定吸烟时间以避免生产安全隐患（如防止火灾），但需合理。例如，禁止在易燃易爆区域吸烟是合法的，但若完全禁止员工在合理时间内吸烟，则可能侵犯员工权益。

3. 从员工权益保护角度看

• 合理性与必要性：公司规定吸烟时间需基于合理理由（如安全生产、工作效率），且不得滥用权利。例如，若公司以“提高效率”为由限制员工每日吸烟次数和时间，但未提供充分证据支持，则可能被认定为不合理。
• 协商与沟通：公司制定此类规定时，应与员工或工会协商，听取意见。若单方面强制执行，可能引发劳动争议。

4. 具体案例与建议

• 合法案例：若公司规定“员工可在工作间隙（如午休、下班前）前往指定吸烟区吸烟，每次不超过10分钟”，且该规定经民主程序制定并公示，通常合法。
• 违法案例：若公司规定“工作时间内禁止吸烟，违者扣发全月奖金”，且未提供合理理由或未经民主程序，则可能违法。
• 建议：
  1. 审查规定内容：检查公司关于吸烟时间的规定是否合理、必要，是否经民主程序制定。
  2. 协商与沟通：若认为规定不合理，可与公司协商或通过工会提出意见。
  3. 法律途径：若公司规定违法且协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：公司规定吸烟时间需兼顾安全生产、员工权益与合法性。若规定合理、程序合法，则通常有效；反之，可能因违法而被认定无效。如有疑问，可直接向我咨询具体案例或规定内容。