公司设置吸烟区是否违法，需结合具体场所性质及地方性法规综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 若公司位于法定全面禁烟场所内，设置吸烟区违法

• 法律依据：根据《上海市公共场所控制吸烟条例》第六条、《北京市控制吸烟条例》第九条等地方性法规，室内公共场所、室内工作场所、公共交通工具内全面禁止吸烟，包括办公室、会议室、走廊等区域。
• 违法后果：
  • 对个人：在禁止吸烟场所吸烟的，可被处以50元至200元罚款（如北京案例中王某某被罚50元）。
  • 对公司：若未履行禁烟管理职责（如未清除烟灰缸、未劝阻吸烟行为），可被处以2000元至3万元罚款（如上海某公司因放任室内抽烟被罚5100元）。
• 示例：若公司在办公楼内设置吸烟区，即使位于独立房间，仍可能因属于“室内工作场所”而被认定为违法。

2. 若公司位于非法定禁烟场所，设置吸烟区需满足以下条件

• 场所性质：需确认公司所在区域是否属于地方性法规明确禁止吸烟的场所（如加油站、幼儿园等）。若不属于，则公司有权自主管理吸烟行为。
• 合规要求：
  1. 区域隔离：吸烟区应与其他工作区域完全隔离，避免烟雾扩散。
  2. 标识明确：在吸烟区及禁烟区醒目位置设置统一标识，并公示监管电话。
  3. 器具管理：禁止在禁烟区放置烟灰缸、打火机等吸烟器具。
  4. 制度完善：通过民主程序制定禁烟规章制度，明确违规处理措施（如扣减绩效奖金、解除劳动合同等）。
• 示例：若公司在独立厂房外设置露天吸烟区，且符合上述条件，则通常不违法。

3. 公司管理吸烟行为的合法路径

• 无罚款权：企业不具备行政处罚权，不能直接对员工吸烟行为罚款。
• 合规管理方式：
  1. 制度约束：将禁烟规定纳入绩效考核，违规者扣减奖金或影响晋升。
  2. 合同解除：若员工严重违反禁烟制度（如多次在禁烟区吸烟且拒不改正），可依据《劳动合同法》第三十九条解除劳动合同。
  3. 举报配合：对不听劝阻的吸烟者，可向卫生健康委员会等监管部门举报。
• 示例：某公司规定“在禁烟区吸烟一次扣减当月绩效10%”，该制度合法有效。

4. 特殊场所的额外注意

• 易燃易爆场所：在加油站、面粉厂等场所吸烟的，不仅违反公司规定，还可能触犯《消防法》第六十三条，面临警告、500元以下罚款或5日以下拘留。
• 公共安全优先：即使公司设置吸烟区，也需确保不威胁公共安全，否则可能承担行政责任甚至刑事责任。

法律建议

1. 核查地方性法规：不同城市对禁烟场所的规定可能不同，需优先遵守当地法规。
2. 完善内部制度：通过职工代表大会制定禁烟制度，并确保公示和员工签收。
3. 加强宣传教育：定期开展控烟培训，普及法律责任和健康危害。
4. 及时整改违规：若被监管部门查处，需立即清除吸烟器具、加强劝阻，避免重复处罚。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合您所在城市的具体法规提供针对性建议。