结论是：公司系统将解除劳动合同弄成自动离职，这一行为是否违法需视具体情况而定，但通常可能涉及违法情形。以下从不同角度进行分析：
一、法律对解除劳动合同与自动离职的界定
解除劳动合同：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，解除劳动合同是指用人单位与劳动者协商一致，或者依据法定情形（如劳动者严重违反用人单位规章制度、不能胜任工作等）由一方提出终止劳动合同关系的行为。解除劳动合同应当遵循法定程序，并可能需要支付经济补偿。
自动离职：自动离职通常指的是劳动者未按照法定程序或合同约定，擅自离开工作岗位的行为。自动离职可能被视为劳动者单方面解除劳动合同，但通常不会获得经济补偿，且可能承担违约责任。
二、公司系统操作违法的可能性分析
未经劳动者同意擅自变更离职性质：
- 如果公司系统在未经劳动者同意的情况下，擅自将解除劳动合同变更为自动离职，这可能构成对劳动者权益的侵害。因为解除劳动合同与自动离职在法律后果上存在显著差异，如经济补偿、违约责任等。
- 这种情况下，公司可能违反了《劳动合同法》中关于解除劳动合同程序的规定，以及关于保护劳动者合法权益的原则。
违反法定程序：
- 解除劳动合同应当遵循法定程序，如提前通知、协商、支付经济补偿等。如果公司系统操作导致这些程序被绕过或忽视，那么公司的行为可能违法。
- 例如，如果公司未按照法定程序解除劳动合同，而是直接通过系统将劳动者状态改为自动离职，这可能构成违法解除劳动合同。
可能涉及的法律后果：
- 如果公司的行为被认定为违法，劳动者有权要求公司继续履行劳动合同、支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
- 同时，公司还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
三、建议与措施
劳动者应保留证据：
- 劳动者在发现公司系统将其解除劳动合同状态改为自动离职后，应尽快保留相关证据，如系统截图、邮件通知、工作记录等。
- 这些证据将有助于劳动者在后续维权过程中证明公司的违法行为。
与公司协商或申请劳动仲裁：
- 劳动者可以尝试与公司协商解决此事，要求公司纠正错误并支付相应的经济补偿。
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
寻求法律援助：
- 在处理此类纠纷时，劳动者可以寻求专业律师的法律援助，以确保自己的权益得到充分保护。
有问题可以直接向我咨询，作为专业律师，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。