针对您提出的“公司要填家属的身份证号码合法吗”这一问题，我们可以从法律角度和隐私保护原则出发进行详细分析。

首先，根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在招用劳动者时，有权了解劳动者与劳动合同直接相关的基本情况，如身份信息、学历信息、过往工作经历等。然而，这些信息应严格限定在与劳动合同直接相关的范围内。对于劳动者家属的身份证号码等敏感信息，并不属于与劳动合同直接相关的基本情况。

其次，从隐私保护的角度来看，《民法典》第一千零三十二条明确规定，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。家属的身份证号码属于个人隐私范畴，未经本人明确同意，公司无权强制获取。

在您所描述的情境中，如果公司要求员工填写家属的身份证号码，且这一要求并非出于与劳动合同直接相关的目的，那么这一行为很可能构成对员工隐私权的侵犯。员工有权拒绝提供此类信息，且这种拒绝并不构成对员工不服从公司管理的认定。

如果公司因此解除与员工的劳动关系，那么公司将面临违法解除劳动关系的法律责任及相应赔偿。员工可以积极收集相关证据，向当地人力资源和社会保障局劳动监察部门投诉，或者直接申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。

综上所述，公司要求员工填写家属的身份证号码并不合法，除非这一要求与劳动合同直接相关且得到了员工的明确同意。在处理此类问题时，公司应尊重员工的隐私权，仅收集与工作直接相关的信息，以确保合法合规地管理员工关系。