结论前置：在医疗损害案件中，如果两个被告中只起诉了一个，而希望另一个被告也参与司法鉴定，这通常需要通过法律程序来实现，不能直接通过司法鉴定机构将未起诉的被告纳入鉴定程序。
一、司法鉴定程序的基本规则
司法鉴定是在诉讼过程中，由法院委托或当事人自行委托具有资质的鉴定机构，对专门性问题进行科学、客观、公正的鉴定，以提供证据支持诉讼活动。在医疗损害案件中，司法鉴定通常用于确定医疗机构是否存在过错、过错与损害后果之间的因果关系以及过错参与度等。然而，司法鉴定机构本身并不具备将未起诉的被告纳入鉴定程序的权力。这是因为司法鉴定的范围和对象通常是由法院的委托或当事人的申请所确定的，且必须遵循诉讼程序的相关规定。
二、未起诉被告参与鉴定的法律途径
追加被告：
- 如果在诉讼过程中发现遗漏了应当参加诉讼的被告，原告可以向法院申请追加被告。法院在审查后，如果认为追加被告是必要的，会通知被追加的被告参加诉讼。
- 一旦被告被追加，法院可以根据案件需要，委托司法鉴定机构对涉及该被告的专门性问题进行鉴定。
另行起诉：
- 如果原告认为未起诉的被告与案件有直接关联，且不愿意或无法在当前诉讼中追加该被告，原告可以选择另行起诉该被告。
- 在另行起诉的案件中，法院可以根据原告的申请或案件需要，委托司法鉴定机构进行鉴定。
三、实际操作中的注意事项
- 及时沟通：在诉讼过程中，如果原告发现遗漏了被告，应及时与法院沟通，了解追加被告的程序和要求。
- 准备充分证据：在申请追加被告或另行起诉时，原告应准备充分的证据来支持其主张，包括但不限于医疗记录、专家意见、证人证言等。
- 遵循诉讼程序：无论是追加被告还是另行起诉，都必须遵循诉讼程序的相关规定，确保诉讼活动的合法性和有效性。
四、可能的法律后果
- 如果未起诉的被告确实存在过错：且该过错与损害后果之间存在因果关系，那么原告有权要求该被告承担相应的赔偿责任。如果原告未起诉该被告，可能会面临无法获得全额赔偿的风险。
- 如果未起诉的被告不存在过错：或者其过错与损害后果之间不存在因果关系，那么即使原告将其纳入诉讼或鉴定程序，也不会改变案件的结果。
建议：如果您在医疗损害案件中只起诉了一个被告，而希望另一个被告也参与司法鉴定，建议您及时与法院沟通，了解追加被告的程序和要求。同时，您也可以考虑另行起诉该被告，以确保您的合法权益得到充分保障。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。