关于上班中途离开是否算旷工以及是否会影响保底工资的问题，需要分情况讨论：

1. 若员工未经批准擅自离岗：

   • 旷工认定：根据一般的劳动纪律和规章制度，员工未经批准擅自离岗，通常会被视为旷工。旷工是违反劳动纪律的行为，用人单位有权依据内部规章制度对员工进行相应的处理。
   • 保底工资影响：如果员工的旷工行为违反了用人单位的规章制度，且该规章制度中明确规定了旷工将影响保底工资的发放，那么用人单位有权扣除或不予发放保底工资。但这一处理必须基于合法、合理的规章制度，并且该规章制度已经过民主程序制定并公示给员工。

2. 若员工因合理原因离岗且已获批准：

   • 旷工不成立：如果员工因合理原因（如突发疾病、家庭紧急事务等）需要离岗，并且已经按照用人单位的规定履行了请假手续并获得了批准，那么这种情况不应被视为旷工。
   • 保底工资不受影响：在员工已获批准离岗的情况下，其保底工资不应受到影响。用人单位应按照劳动合同的约定和相关法律法规的规定，按时足额支付员工的工资。

3. 关于保底工资的法律规定：

   • 保底工资的性质：保底工资通常是用人单位与员工在劳动合同中约定的，确保员工在一定工作条件下能够获得的最低工资标准。它不同于绩效工资或奖金，不受员工工作表现或业绩的直接影响。
   • 扣除工资的合法性：根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，用人单位不得随意扣除员工的工资。只有在员工违反规章制度、造成经济损失等特定情况下，用人单位才能依法扣除工资，且扣除的金额不得超过法定标准。

法律建议：

• 对于员工而言，应严格遵守用人单位的规章制度和劳动纪律，如需离岗应提前履行请假手续并获得批准。
• 对于用人单位而言，应制定合法、合理的规章制度，并明确规定旷工等违纪行为的处理方式和保底工资的发放条件。同时，用人单位在处理员工违纪行为时，应确保程序合法、证据充分，避免侵犯员工的合法权益。

可能后果：

• 如果员工未经批准擅自离岗被认定为旷工，且用人单位依据规章制度扣除了保底工资，员工可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
• 如果用人单位的规章制度不合法或不合理，或者处理程序存在瑕疵，员工有权要求用人单位撤销处理决定并补发工资。

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