结论：借款到期未还时，重新出具借条并将违约金加入本金这一做法需要谨慎处理，一般情况下不建议直接将违约金加入本金，因为这可能涉及利息计算、法律合规性以及后续纠纷处理等多方面的问题。
一、法律合规性角度
利息与违约金的规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，借贷双方可以约定利息，但利息的约定应当符合法律规定的上限（如LPR的四倍）。
- 违约金是双方约定的因一方违约而应支付给另一方的金额，其性质与利息不同。将违约金直接加入本金，可能模糊了利息与违约金的界限，导致法律上的混淆。
复利计算的限制：
- 如果将违约金加入本金，并在此基础上继续计算利息，这实际上构成了复利计算。在我国法律中，复利计算受到严格限制，除非双方有明确约定且不超过法定上限，否则可能不被法律认可。
二、实际操作角度
明确约定：
- 如果双方确实希望将违约金作为借款的一部分进行后续处理，应当在重新出具的借条中明确约定违约金的性质、金额以及处理方式，避免后续产生纠纷。
- 例如，可以约定违约金在借款到期未还时作为额外债务，但不直接加入本金计算利息，或者约定在特定条件下违约金可以转化为本金的一部分。
风险防控：
- 将违约金加入本金可能增加借款人的还款压力，进而增加违约风险。出借人应当评估借款人的还款能力，避免因约定不当而导致资金损失。
- 同时，借款人应当仔细阅读借条条款，确保自己能够承担还款责任，避免因不了解条款而陷入法律纠纷。
三、纠纷处理角度
证据保留：
- 无论是否将违约金加入本金，双方都应当保留好相关证据，如借条、转账记录、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
法律途径解决：
- 如果因借款问题发生纠纷，双方应当首先通过协商解决。协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
- 在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据法律规定和双方约定来判定违约金的性质和处理方式。
建议：在借款到期未还时，双方应当谨慎处理违约金的加入本金问题。如果确实需要重新出具借条并涉及违约金的处理，建议咨询专业律师以制定合法、合规且明确的条款。如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。