公务员在疾病治疗期间，单位一般是不应扣工资的。具体来说，公务员在患病期间的工资待遇与其病假时长及工作年限密切相关，以下是对相关规定的详细说明：

一、病假工资待遇规定

1. 病假在2个月以内（不含公休节假日）：

   • 公务员的原工资照发，即工资收入不因病假而减少，按照正常出勤时的标准全额发放。

2. 病假超过2个月但不足6个月：

   • 工作年限10年及以下：从第3个月起，按本人标准工资的90%计发。
   • 工作年限11年及以上：原工资照发，即依然按照正常的标准工资全额发放。

3. 病假超过6个月：

   • 工作年限10年及以下：从第7个月起，按本人标准工资的70%计发。
   • 工作年限11-20年：从第7个月起，按本人标准工资的80%计发。
   • 工作年限21年以上：从第7个月起，按本人标准工资的90%计发。

二、特殊情况说明

1. 获得相关荣誉人员：

   • 1945年9月2日以前参加革命工作的人员，病假期间工资照发。
   • 省、市、自治区人民政府和国务院各部门授予的劳动英雄、劳动模范，以及享受省部级及以上劳动模范待遇的人员，其病假在6个月以内的，原工资照发；病假超过6个月的，从第7个月起，其病假期间工资可在相应工作年限计发病假工资基础上提高10%-15%，但最多不得超过本人原工资数额。

2. 长期病假人员：

   • 对长期病假人员，单位应根据病情积极给予治疗。经过医院证明确定不能坚持正常工作，并经任免机关批准，可办理退休（退职）手续。

三、地区差异与咨询建议

• 不同地区可能会根据当地实际情况，在国家规定的基础上出台一些具体的实施细则或补充规定。因此，实际执行时应以当地政策为准。
• 如有任何疑问或需要具体了解本单位的相关规定，建议咨询所在单位的人事部门或财务部门，或者查阅相关的官方文件和政策解读。

总结与建议：

公务员在疾病治疗期间，单位一般是不应扣工资的，而是根据病假时长和工作年限来发放相应的病假工资。同时，对于获得相关荣誉的人员，还有特别的工资待遇规定。在实际操作中，应关注当地政策和单位的具体规定，以确保自己的权益得到准确保障。如果遇到单位扣工资的情况，可以与单位进行沟通协商，或者向相关部门进行投诉举报。

如果您在公务员疾病治疗期间的工资待遇方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。