公务员患癌长期病假期间，工资是否会被扣除，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 公务员病假工资的一般规定

根据《公务员法》及相关规定，公务员因病需要停止工作进行治疗时，可以享受病假待遇。在病假期间，公务员的工资支付通常遵循以下原则：

• 短期病假：一般情况下，短期病假（如几天至一个月）期间，公务员的工资会全额发放，不会因病假而扣除。
• 长期病假：对于长期病假（如超过一个月），工资支付可能会根据病假期限和单位规定有所调整。但调整并非简单扣除，而是可能按照一定比例或标准发放病假工资。

2. 患癌长期病假的特殊情况

对于公务员患癌这种特殊情况，长期病假期间的工资支付可能会更加人性化：

• 医疗期保护：公务员患癌后，通常会享有较长的医疗期。在医疗期内，单位一般不会随意扣除工资，而是会按照相关规定或单位政策发放病假工资。
• 单位政策：不同单位对于公务员病假工资的支付政策可能有所不同。有些单位可能会提供更为优厚的病假待遇，如全额发放工资或提供额外的医疗补助。
• 法律法规：虽然《公务员法》等法律法规对公务员病假工资有一般性规定，但具体实施时还需结合地方性法规、单位规章制度以及劳动合同等文件。

3. 实际操作中的建议

• 了解单位政策：公务员在患癌长期病假前，应详细了解所在单位的病假工资支付政策，包括病假期限、工资发放比例等。
• 保留相关证据：在病假期间，应妥善保留医疗证明、病假条等相关证据，以备不时之需。
• 与单位沟通：如对病假工资支付有疑问或不满，应及时与单位人事部门或相关负责人沟通，寻求解决方案。
• 寻求法律援助：如单位违反规定扣除工资或未提供应有的病假待遇，公务员可以寻求法律援助，维护自身合法权益。

4. 可能的法律后果

如果单位违反规定扣除公务员患癌长期病假期间的工资，公务员有权：

• 要求单位补发工资：根据相关规定，公务员可以要求单位补发被扣除的工资。
• 投诉或举报：如单位拒绝补发工资或存在其他违法行为，公务员可以向相关部门投诉或举报。
• 提起诉讼：在必要时，公务员还可以通过法律途径提起诉讼，维护自身权益。

总结来说，公务员患癌长期病假期间，工资是否会被扣除需根据具体情况和单位政策来判断。在大多数情况下，单位会遵循相关法律法规和单位政策，为公务员提供合理的病假待遇。如有任何疑问或不满，建议及时与单位沟通并寻求法律援助。