公务员长期病假是否扣房补，需根据具体情况判断，一般而言，若符合病假工资发放规定且房补与工资挂钩，则可能按比例扣减；若房补有独立规定或属特殊补贴，则可能不受影响。以下从不同角度进行分析：
一、病假工资发放规定对房补的影响
病假工资发放原则：
- 根据相关规定，公务员病假期间的工资发放通常遵循一定的比例原则，即根据病假时间长短，工资按一定比例发放。例如，病假在2个月以内的，发给原工资；病假超过2个月的，从第3个月起，工作年限不满10年的，发给本人工资的90%，工作年限满10年的，工资照发；病假超过6个月的，从第7个月起，工作年限不满10年的，发给本人工资的70%，工作年限满10年及以上的，发给本人工资的80%。
房补与工资挂钩的情况：
- 如果公务员的房补是作为工资的一部分或与工资挂钩发放的，那么在病假期间，随着工资的按比例扣减，房补也可能相应扣减。这是因为房补作为工资的组成部分，其发放通常与工资的发放原则相一致。
二、房补独立规定或特殊补贴的情况
房补独立规定：
- 有些单位或地区可能对房补有独立的规定，即房补的发放不依赖于工资的发放情况。在这种情况下，即使公务员因病假导致工资扣减，房补也可能不受影响，仍按原标准发放。
特殊补贴性质：
- 如果房补被视为一种特殊补贴，如针对特定岗位、特定地区或特定情况的补贴，那么其发放可能不受病假工资发放规定的影响。这种补贴通常具有特定的发放条件和标准，与工资的发放原则相独立。
三、实际操作中的建议
查阅单位规定：
- 公务员在面临长期病假时，应首先查阅所在单位或地区关于病假工资和房补发放的具体规定。这些规定通常会在单位的规章制度或相关政策文件中明确说明。
咨询人事部门：
- 如果对规定存在疑问或不确定如何理解，公务员可以咨询所在单位的人事部门或相关负责人。他们能够提供更具体、更权威的解答和指导。
保留相关证据：
- 在病假期间，公务员应保留好与病假相关的医疗证明、请假手续等证据材料。这些材料在后续可能涉及的工资和房补争议中具有重要的证明作用。
总结来说，公务员长期病假是否扣房补，需根据单位规定、房补性质以及病假工资发放原则等多方面因素综合判断。如有疑问，建议及时咨询所在单位的人事部门或相关负责人，以获取更准确、更权威的解答。