国企员工病假工资里考勤扣款是否合法，需分情况讨论：

1. 若考勤扣款针对的是病假期间以外的缺勤：

   • 这种情况下，考勤扣款通常是合法的。因为员工在病假期间以外的缺勤，违反了公司的考勤制度，公司有权根据规章制度对员工进行相应的扣款处理。这是公司管理员工、维护工作秩序的一种正常手段。

2. 若考勤扣款针对的是病假期间内的缺勤：

   • 一般情况下不合法：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及相关劳动法律法规，员工在病假期间享有相应的病假工资待遇，公司不得随意扣除。病假工资是员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，企业应支付的工资报酬。如果公司在病假期间内对员工进行考勤扣款，可能违反了相关法律法规。
   • 特殊情况下的合法性：虽然一般情况下病假期间不得扣款，但如果公司的规章制度中明确规定了病假期间某些特定情况下的扣款条款（如员工提供虚假病假证明等），且这些条款不违反法律法规的强制性规定，同时公司能够证明员工确实存在这些违规行为，那么在这种情况下，公司对员工进行扣款可能是合法的。不过，这种情况较为特殊，需要具体分析公司的规章制度和员工的实际行为。

法律建议：

• 如果您认为公司的考勤扣款行为不合法，首先可以与公司进行沟通协商，要求公司纠正不当的扣款行为。
• 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，请求劳动监察部门介入调查并处理。
• 同时，您也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

可能后果：

• 如果公司的考勤扣款行为被认定为不合法，公司可能需要承担补发工资、支付经济补偿金等法律责任。
• 如果员工因此与公司发生劳动争议并提起诉讼或仲裁，可能会耗费一定的时间和精力，但这也是维护自己合法权益的必要途径。

在处理此类问题时，建议您保留好相关证据（如病假证明、工资条、考勤记录等），以便在需要时能够证明自己的主张。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。