国庆节期间基层政府上班是否合法，主要取决于是否遵守了相关法律法规，特别是关于加班工资支付和劳动者休息权保护的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、合法情况
法定节假日与加班工资：
- 国庆节作为国家法定节假日，劳动者享有休息的权利。但若因工作需要，基层政府安排员工在国庆节期间上班，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条第三款的规定，应当支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。若基层政府依法支付了加班工资，则这种行为是合法的。
特殊工作安排：
- 对于某些特殊岗位或紧急任务，基层政府可能需要在国庆节期间安排员工上班。在这种情况下，只要政府确保了员工的合法权益，如支付了相应的加班工资，并尽可能安排补休（尽管补休不适用于法定节假日，但可作为对员工的一种补偿），则这种安排也是合法的。
二、违法情况
未支付或低于标准支付加班工资：
- 如果基层政府强制员工在国庆节期间上班，但未支付加班工资，或支付的加班工资低于法定标准（即不低于工资的百分之三百），则构成违法行为。员工有权要求政府支付应得的加班工资，并可能通过法律途径维护自己的权益。
未经同意的超时加班：
- 即使基层政府支付了加班工资，但如果加班未经员工同意，且超出了合理范围，同样可能构成违法。员工的休息权受法律保护，政府不得随意侵犯。在这种情况下，员工有权拒绝超时加班，并可能向劳动行政部门投诉。
三、维权途径
协商调解：
- 员工首先可与基层政府进行协商调解，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于快速解决问题，避免不必要的法律纠纷。
向劳动行政部门投诉：
- 如果协商无果，员工可向当地劳动行政部门投诉。劳动行政部门有权责令基层政府支付加班工资或进行其他相应处理，以维护员工的合法权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 员工还可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或对仲裁结果不服时向人民法院提起诉讼。通过法律程序来维护自己的合法权益是员工的正当权利。
四、总结与建议
- 总结：国庆节期间基层政府上班是否合法，关键在于是否遵守了相关法律法规，特别是关于加班工资支付和劳动者休息权保护的规定。如果政府依法行事，则上班是合法的；反之，则可能构成违法。
- 建议：对于基层政府而言，应尽可能避免在国庆节期间安排员工上班，以尊重员工的休息权。如果确实需要安排上班，则应依法支付加班工资，并尽可能安排补休或其他形式的补偿。对于员工而言，如果遇到政府违法安排上班或未支付加班工资的情况，应勇敢维护自己的合法权益，通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来解决问题。
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