在拒绝配合亲子鉴定的情况下，法院可以根据相关证据和法律规定推定亲子关系成立或不成立。以下从不同角度进行分析：
一、法律推定原则
根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释(一)》第三十九条第二款的规定：
父或者母以及成年子女起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定确认亲子关系一方的主张成立。
这意味着，如果一方能够提供初步证据证明亲子关系的存在（如聊天记录、共同生活的证据等），而另一方拒绝配合亲子鉴定且没有提供相反证据，法院可以推定亲子关系成立。
二、证据要求与推定条件
初步证据：主张亲子关系成立的一方需要提供初步证据，这些证据可以是直接的（如亲子鉴定报告，但在对方拒绝配合的情况下无法获得）或间接的（如共同生活的照片、视频、聊天记录、证人证言等）。间接证据需要达到高度盖然性的标准，即能够使法官产生内心确信，认为亲子关系存在的可能性较大。
对方拒绝配合：在对方拒绝配合亲子鉴定的情况下，法院会考虑这一行为对案件事实认定的影响。如果对方没有合理的理由拒绝配合，且没有提供相反证据，法院可能会倾向于推定主张亲子关系成立的一方的主张。
综合判断：法院在推定亲子关系时，会综合考虑所有相关证据和情况，包括但不限于初步证据、对方的行为和态度、以及案件的具体背景等。
三、实际案例与司法实践
在实际案例中，法院通常会根据上述原则进行推定。例如，在某起案件中，女方提供了与男方的聊天记录，其中男方未否认亲子关系的存在，且男方拒绝配合亲子鉴定。法院在综合考虑所有证据后，推定了亲子关系的成立。
四、法律后果与责任
如果法院推定亲子关系成立，那么拒绝配合亲子鉴定的一方可能需要承担相应的法律责任，如支付抚养费、承担精神损害赔偿等。这些责任是基于亲子关系的认定而产生的，因此推定亲子关系的成立对案件的处理具有重要影响。
五、建议与注意事项
提供充分证据：主张亲子关系成立的一方应尽可能提供充分的初步证据，以支持自己的主张。
尊重法院程序：在诉讼过程中，应尊重法院的程序和要求，积极配合法院的工作。
考虑法律后果：在拒绝配合亲子鉴定前，应充分考虑可能承担的法律后果和责任。
温馨提示：亲子关系的认定是一个复杂而敏感的问题，涉及到家庭关系、子女权益等多个方面。因此，在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。如果你有任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供帮助。