经过上级批准的行政行为，若成为被告，行政机关应依法积极应诉，并可根据具体情况采取以下处理方式：

1. 确认行政行为的合法性与合理性
   首先，行政机关需对被诉行政行为进行全面审查，确认其是否严格遵循法定程序、是否具备充分的事实依据和法律依据。若行政行为合法合理，行政机关应在诉讼中积极举证，证明其行为的正当性。

2. 准备应诉材料并提交证据
   行政机关需按照法院要求，准备并提交行政行为的相关证据材料，包括但不限于上级批准文件、行政程序记录、事实认定依据等。证据应充分、完整，以支持行政行为的合法性。

3. 参与诉讼程序并积极答辩
   行政机关应委派具有法律知识和诉讼经验的代表参与诉讼，按照法院安排参与庭审、质证等程序。在答辩过程中，应针对原告的诉讼请求和理由，逐一进行反驳和说明，维护行政行为的合法性。

4. 考虑行政行为的调整或撤销
   若在诉讼过程中发现行政行为存在违法或不当之处，行政机关应主动考虑调整或撤销该行为。这不仅可以减少诉讼风险，还有助于维护行政机关的公信力和形象。

5. 尊重并执行法院判决
   无论诉讼结果如何，行政机关都应尊重法院的判决，并按照判决要求履行相应义务。若对判决不服，可在法定期限内提出上诉或申请再审，但在此期间应暂停执行与判决相冲突的行政行为。

在处理此类案件时，行政机关还需注意以下几点：

• 加强内部审查与监督：行政机关应建立健全内部审查机制，对行政行为进行事前、事中、事后的全面监督，确保行政行为的合法性和合理性。
• 提升法律素养与应诉能力：行政机关应加强对工作人员的法律培训，提升其法律素养和应诉能力，以便更好地应对行政诉讼。
• 注重与原告的沟通与协商：在诉讼过程中，行政机关可尝试与原告进行沟通与协商，寻求和解或调解的可能性，以降低诉讼成本并维护社会稳定。

若您在此类案件中遇到具体法律问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细、专业的法律意见。