在原告有证据而被告不承认的情况下，法院会依据证据的合法性、真实性和关联性进行审查判断，被告单纯的否认通常无法直接否定证据的效力。以下从不同角度为您详细分析：
一、法院对证据的审查标准
合法性：法院首先会审查证据的取得方式是否合法。例如，书证是否有原件，证人是否具备作证资格等。如果证据是通过非法手段获取的，那么它很可能不会被法院采信。
真实性：法院会审查证据的内容是否真实可靠，有无矛盾之处。对于有争议的证据，法院可能会要求双方进一步举证、质证，甚至通过庭审调查、询问证人等方式来核实证据的可信度。例如，如果一方对对方提供的合同真实性存疑，可以申请鉴定合同上签名或印章的真伪。
关联性：法院会考量证据与待证事实之间是否存在关联。如果证据与案件事实无关，那么它就无法作为定案的依据。
二、被告不承认证据的法律后果
无法直接否定证据效力：被告单纯的否认，如果没有提供任何反证来推翻原告的证据，那么这种否认很可能无法得到法院的认可。因为证据的证明力需要经法院依职权全面审查判断，并非被告不承认就当然无效。
可能面临不利后果：如果被告无法提供有效的反证来推翻原告的证据，而原告的证据又能够形成完整的证据链条，达到高度盖然性的证明标准，那么法院很可能会采信原告的证据，并据此作出对被告不利的判决。
三、原告的应对策略
确保证据完整性和可信度：原告应当确保所提供的证据是完整、真实、可靠的，并且与案件事实密切相关。这样，即使被告不承认，法院也有可能采信这些证据。
积极应诉，准备充分：在庭审过程中，原告应当积极应诉，准备好相关的证据材料，并在法庭上清晰地陈述自己的观点和理由。同时，也要对被告可能提出的反驳意见做好充分的准备。
四、特殊情况的处理
申请鉴定或调查取证：如果对于某些证据的真实性存在争议，原告可以申请法院进行鉴定或者调查取证。例如，对于合同上的签名或印章的真伪进行鉴定，或者对于某些事实进行调查取证。
利用其他证据形成证据链：如果原告的某一项证据存在瑕疵或者无法单独证明案件事实，那么原告可以尝试利用其他证据来形成完整的证据链条，从而增强证据的证明力。
举例说明：假设在一个合同纠纷案件中，原告提供了合同原件作为证据，但被告否认合同的真实性。在这种情况下，法院会审查合同原件的真实性、关联性和合法性。如果合同原件是真实、合法且与案件事实密切相关的，那么即使被告否认，法院也有可能采信这份证据。如果被告无法提供有效的反证来推翻这份证据，那么法院很可能会根据这份证据作出对被告不利的判决。
总之，在面对被告不承认证据的情况时，原告应当保持冷静，确保自己的证据完整、真实、可靠，并积极应诉。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。