当被告在法庭上不承认原告提出的证据时，这是一个涉及法律程序和证据审查的重要环节。以下是我为您详细梳理的处理流程和建议：
一、证据审查的基本原则
首先，法院会依据证据的“三性”——真实性、关联性和合法性，对原告提出的证据进行综合审查。原告有责任确保其证据在这三方面都经得起考验，而被告则有权对证据提出质疑。
二、针对证据真实性的处理
原告举证：原告需要详细阐述证据的来源、形成过程以及保管情况，必要时可以申请相关证人出庭作证，或者提供其他辅助材料来证明证据的真实性。
法院审查：法院会结合案件的整体情况、双方当事人的陈述以及日常生活经验法则，对证据进行综合评估。特别是会仔细检查证据是否存在篡改或伪造的迹象。
三、针对证据关联性的处理
原告说明：原告必须清晰解释证据与案件待证事实之间的直接联系，说明该证据如何能够证明或反驳案件中的某一关键事实。
法院认定：法院会判断证据所反映的事实是否与案件的争议焦点紧密相关，以及其对案件解决是否具有实质性影响。
四、针对证据合法性的处理
原告举证：原告需要证明证据的收集方式、手段均符合法律规定，没有侵犯他人的合法权益或违反法律的禁止性规定。
法院审查：法院会严格审查证据的取得途径和方式，对于违法获取的证据，将依法予以排除。
五、被告的反驳与应对策略
提出反驳证据：被告应积极收集并提交能够反驳原告证据或支持自己主张的证据材料。
申请法院调查：如果被告因客观原因无法自行收集证据，可以向法院申请调查取证，以确保证据的客观性和公正性。
利用质证程序：在庭审过程中，被告应充分利用质证环节，对原告的证据进行细致审查，并提出有针对性的质疑。
六、专业支持与鉴定
寻求法律帮助：如果被告对法律程序或证据审查感到困惑，可以咨询专业律师以获取法律分析和诉讼策略建议。
申请司法鉴定或专家证人：如果案件涉及专门性问题，被告可以向法院申请司法鉴定或邀请专家证人出庭作证，提供专业意见以增强说服力。
七、特殊情况下的处理
在刑事诉讼中，即使被告人不承认犯罪事实，只要控方能够提供确实、充分的证据，这些证据能够相互印证并形成完整的证明体系，法院依然可以依法认定被告人有罪。
在民事诉讼中，如果原告无法提供充分证据支持其主张，而被告又不承认，那么原告可能面临败诉的风险。此时，法院会根据双方提交的证据和事实推定规则来作出裁决。
总结与建议：
当被告不承认原告的证据时，双方都应遵循法庭规则和程序要求，积极举证、提出反驳，并充分利用质证程序和专业支持来维护自身权益。法院将依据法律规定和案件事实，对证据进行全面、客观、公正的审查判断，并最终作出裁决。因此，建议您在面对此类情况时，保持冷静、理性应对，并寻求专业法律帮助以确保您的权益得到充分保障。