与邻居就建房事宜签订的协议是否有效，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的情形
双方真实意思表示：
- 协议必须是双方在平等、自愿的基础上签订的，不存在欺诈、胁迫等情形。例如，双方通过友好协商，就房屋的高度、朝向、边界等建房相关事宜达成一致，并签订书面协议，这样的协议通常是有效的。
内容合法合规：
- 协议内容不得违反法律法规的强制性规定，以及不得损害公共利益和他人合法权益。比如，协议中约定的建房标准需符合当地的城市规划、建筑规范等要求。
已履行必要审批手续：
- 如果建房需要取得相关部门的审批或许可，那么协议中应明确双方已履行或承诺履行这些手续。例如，双方已按照当地规定申请了建房许可，并在协议中注明了许可编号或相关证明文件。
二、协议可能无效或可撤销的情形
存在重大误解或显失公平：
- 如果协议签订时，一方对协议内容存在重大误解，或者协议条款显失公平（如一方承担过多义务而享受过少权利），那么受损害方有权请求法院或仲裁机构变更或撤销协议。
违反当地建房规划或审批规定：
- 如果协议内容违反了当地关于建房的规划、审批等强制性规定，那么协议可能会被认定为无效。例如，未取得建房许可而签订的涉及违法建房内容的协议，即便双方自愿达成，也可能因违反法律规定而无效。
恶意串通损害第三人利益：
- 如果协议的签订存在恶意串通，损害第三人（如其他邻居、公共利益等）利益的情形，那么协议同样不具有法律效力。
三、法律建议
审查协议内容：
- 在签订协议前，务必仔细审查协议条款，确保内容合法合规，且不存在重大误解或显失公平的情况。
履行必要手续：
- 如果建房需要取得相关部门的审批或许可，务必在签订协议前或协议中明确双方已履行或承诺履行这些手续。
咨询专业律师：
- 由于建房协议涉及的法律问题较为复杂，建议在签订协议前咨询专业律师，以确保协议的有效性和自身权益的保障。不过，您现在就可以直接向我咨询相关法律问题，我会为您提供专业的法律意见。
保留证据：
- 在签订和履行协议过程中，务必保留好相关证据（如协议文本、审批文件、沟通记录等），以备不时之需。