结论：工伤期间只发底薪，若该底薪低于劳动者应得的工伤待遇标准，劳动者可以以不足额支付为由提起劳动仲裁或诉讼，但需根据具体情况判断。
一、法律依据与工伤待遇标准
根据《工伤保险条例》及相关规定，劳动者在工伤期间享有停工留薪期待遇，即原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指的是劳动者在工伤前12个月的平均工资，包括基本工资、奖金、津贴等所有货币性收入。因此，若单位仅支付底薪，且该底薪明显低于劳动者工伤前的平均工资水平，则可能构成不足额支付。
二、是否可以起诉或申请仲裁
若单位未按照法定标准支付工伤待遇：
- 劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求单位补足差额部分，并可能要求支付相应的经济补偿或赔偿金。
- 若对仲裁结果不服，劳动者还可以向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
若单位支付的底薪虽低于平均工资，但双方有特别约定：
- 如果劳动者与单位在劳动合同或工伤协议中明确约定了工伤期间的待遇标准，且该标准不低于法定最低标准，那么单位按照约定支付底薪可能不构成违法。
- 但若约定标准明显低于法定标准，且劳动者未明确表示接受，则该约定可能无效，劳动者仍有权要求单位按照法定标准支付。
三、实际操作建议
收集证据：
- 劳动者应收集好工伤前的工资单、银行流水等证据，以证明自己的平均工资水平。
- 同时，保留好工伤期间的工资支付记录，以便与工伤前的工资进行对比。
与单位协商：
- 在提起劳动仲裁或诉讼前，劳动者可以尝试与单位进行协商，要求单位按照法定标准补足差额。
- 协商过程中，可以引用相关法律法规，增强自己的说服力。
寻求法律援助：
- 若协商无果，劳动者可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及提起劳动仲裁或诉讼的具体流程和注意事项。
四、可能面临的法律后果
- 若单位被认定存在不足额支付工伤待遇的行为，可能面临劳动行政部门的处罚，包括责令限期支付、加付赔偿金等。
- 同时，单位还可能因违反劳动合同或相关法律法规而承担民事责任，如支付经济补偿金、赔偿金等。
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