领导让超市员工赔偿是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
员工存在故意或重大过失
- 如果员工在工作过程中因故意或重大过失给超市造成了经济损失，比如故意损坏商品、违规操作导致设备故障、业务失误致使公司遭受重大经济损失等，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，超市在对外承担相应责任后，有权向这些有故意或重大过失的员工追偿部分或全部损失。但追偿的比例和金额应结合具体情况合理确定，且从员工工资中扣除的部分不得超过当月工资的20%，扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
员工不存在故意或重大过失
- 如果员工已经按照超市规定的流程和要求进行工作，且没有故意或重大过失，而损失的出现是由于商品供应商提供的商品本身存在问题、超市管理制度不完善、市场环境变化等非员工原因导致的，那么超市要求员工赔偿是不合法的。此时，让员工承担赔偿责任缺乏法律依据。
超市是否尽到告知和管理义务
- 超市有责任明确告知员工相关的操作规范、质量要求以及可能面临的风险，并提供必要的培训和支持。如果超市没有尽到这些告知和管理义务，员工在不知情或无法预防的情况下导致出现损失，此时要求员工赔偿也是不合理的。因为员工履行工作职责需要以明确的指示、要求和必要的支持为前提，超市未尽到相关义务，就不能将责任全部归咎于员工。
超市的规章制度与法律责任
- 超市在制定规章制度时，应确保其内容合法、合规，不侵犯员工的合法权益。超市不能随意扣减员工工资或采取其他侵犯员工权利的行为来作为对损失的赔偿。一切赔偿要求都应基于法律法规和公平合理的原则进行。如果超市的规章制度违反了法律法规或侵犯了员工的合法权益，那么这些规章制度是无效的，超市不能依据这些规章制度要求员工赔偿。
总结与建议：
- 超市在要求员工赔偿时，必须确保其行为符合法律法规的要求，不能随意要求员工承担赔偿责任。
- 在判断员工是否需要承担责任时，应综合考虑员工的过错程度、超市的告知和管理义务以及规章制度的合理性等因素。
- 如果员工认为超市的要求不合理或违法，可以与超市协商解决，协商不成可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自身合法权益。
如果你或你身边的超市员工遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。