结论：学校请假一个月扣完绩效还要给补每天请假的顶课费是否合法，需根据具体情况判断，包括劳动合同或学校规章制度的约定、扣款及顶课费的合理性等。以下从不同角度进行分析。
一、劳动合同或学校规章制度的约定
若劳动合同或学校规章制度中有明确规定：
- 如果劳动合同或学校规章制度中明确规定了请假期间的绩效扣款和顶课费支付事项，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么学校按照这些规定执行是合法的。
- 但需要注意的是，规章制度必须经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、协商确定），并公示或告知劳动者，否则可能因程序瑕疵而被认定为无效。
若劳动合同或学校规章制度中无明确规定：
- 如果劳动合同或学校规章制度中没有对请假期间的绩效扣款和顶课费支付作出明确规定，那么学校单方面扣款和要求支付顶课费可能缺乏合法依据。
- 在这种情况下，劳动者有权拒绝学校的无理要求，并可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
二、扣款及顶课费的合理性
绩效扣款的合理性：
- 绩效扣款应当与劳动者的实际工作表现和贡献相关联。如果劳动者因请假而未能完成工作任务或达到绩效标准，学校可以根据实际情况扣减相应的绩效工资。
- 但扣款金额应当合理，不得超过劳动者当月工资的20%（根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。如果扣款金额过高，可能构成违法克扣工资。
顶课费的合理性：
- 顶课费通常是指因劳动者请假而需要其他教师代课所产生的费用。如果学校能够证明顶课费的实际发生和金额合理性，且该费用未转嫁给劳动者承担（即由学校自行承担或通过其他合理方式解决），则要求劳动者支付顶课费可能缺乏合法依据。
- 如果学校将顶课费转嫁给劳动者承担，且该费用超出了劳动者因请假而给学校造成的实际损失范围，那么这种做法可能不合法。
三、法律建议
审查劳动合同和学校规章制度：
- 劳动者应仔细审查自己的劳动合同和学校规章制度，了解其中关于请假、绩效扣款和顶课费支付的规定。
与学校协商：
- 如果劳动者认为学校的扣款和顶课费要求不合理，可以与学校进行协商，寻求妥善解决方案。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结：学校请假一个月扣完绩效还要给补每天请假的顶课费是否合法，需根据劳动合同或学校规章制度的约定以及扣款和顶课费的合理性来判断。如果劳动者对此有疑问或认为学校的做法不合法，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。