综合工时制下，双休日工作并不必然视为加班，是否支付加班费需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一、综合工时制的定义与特点

综合工时制，即综合计算工时工作制，是指用人单位因工作性质特殊或受季节及自然条件限制，需安排职工连续作业，无法实行标准工时制度，而采用以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间的一种工时制度。其核心在于“综合计算”，即在一个计算周期内，职工的总工作时间可以超过标准工作时间，但平均每天或每周的工作时间应与法定标准工作时间基本相同。

二、双休日工作在综合工时制下的性质

1. 不视为加班的情况：

   • 在综合工时制下，如果职工在一个计算周期内的总工作时间未超过法定标准工作时间（如月工作时间不超过166.64小时，季工作时间不超过500小时，年工作时间不超过2000小时），那么即使职工在双休日工作，也不视为加班。这是因为综合工时制允许在一定周期内灵活安排工作时间，以适应工作需要。

2. 视为加班的情况：

   • 如果职工在一个计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，那么超出部分应视为加班。此时，无论这些超出时间是在工作日还是双休日完成的，用人单位都应按照法律规定支付加班费。具体来说，超出部分应按照不低于工资的百分之一百五十的标准支付加班费；如果休息日工作又不能安排补休的，应按照不低于工资的百分之二百的标准支付加班费（但需注意，在综合工时制下，通常不会单独计算双休日的加班费，而是将超出部分统一计算）。

三、法律建议与注意事项

1. 明确工时制度：

   • 用人单位在实行综合工时制前，应依法向劳动保障行政部门申请并获得批准。同时，应与职工明确约定工时制度、计算周期、加班费支付标准等事项，以避免纠纷。

2. 合理安排工作时间：

   • 用人单位应合理安排职工的工作时间，确保在一个计算周期内总工作时间不超过法定标准。如需安排职工在双休日工作，应尽量安排补休或支付加班费。

3. 保留证据：

   • 职工应保留好与工作时间、加班费相关的证据，如考勤记录、工资条等。如发生纠纷，这些证据将有助于维护自己的合法权益。

4. 及时维权：

   • 如职工认为自己的合法权益受到侵害，应及时向劳动保障行政部门投诉或申请劳动仲裁。在维权过程中，应提供充分的证据支持自己的主张。