故意伤害案件双方调解好了，公安机关一般不可以直接撤销案件。这主要取决于案件的性质和情节，以下从不同角度进行详细分析：
一、尚未构成犯罪的轻微伤害案件
如果故意伤害行为情节较轻，未构成犯罪，仅属于违反《治安管理处罚法》的行为，那么依据该法第九条的规定，对于因民间纠纷引起的打架斗殴或者损毁他人财物等违反治安管理行为，情节较轻的，公安机关可以调解处理。经公安机关调解，当事人达成协议的，不予处罚。这意味着，对于此类轻微伤害案件，在调解成功后，公安机关可以不再对行为人进行处罚，相当于撤案。但需要注意的是，这里的“撤案”并非严格意义上的刑事案件撤销，而是治安案件的不予处罚。
二、构成犯罪的故意伤害案件
公诉案件：
- 性质与程序：当故意伤害行为达到轻伤及以上程度时，就构成了故意伤害罪，这属于公诉案件。公诉案件的立案、侦查、起诉和审判均由国家司法机关依法进行，代表国家公共权力，不允许当事人自行协商撤诉。
- 调解的作用：虽然公诉案件不能通过调解直接撤案，但如果犯罪嫌疑人积极赔偿被害人损失、取得被害人谅解并达成和解，这可以作为量刑时从轻处罚的情节予以考虑。调解成功并不改变案件的性质和诉讼程序，只是作为司法机关在量刑时的一个参考因素。
- 撤案条件：根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，公安机关在侦查过程中，如果发现犯罪情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，或者侦查中发现有其他依法不应追究刑事责任的情形，如犯罪已过追诉时效期限等，应当撤销案件。但这些条件与双方是否调解成功无直接关系。
自诉案件：
- 定义与条件：如果是被害人有证据证明的轻微故意伤害案件，且符合自诉条件（如被害人告诉才处理、被害人有证据证明等），则属于自诉案件。
- 撤案的可能性：根据《刑事诉讼法》的规定，自诉人在宣告判决前可以与被告人自行和解或者撤回自诉。因此，这类自诉的故意伤害案件在双方当事人达成和解后是可以撤案的。但需要注意的是，自诉案件的撤案需要自诉人主动向法院提出申请，并经法院审查同意后才能实现。
三、调解与撤案的区别及建议
- 调解：是双方当事人在自愿基础上，通过协商达成一致意见，旨在化解矛盾、促进和谐。调解成功并不意味着案件被撤销，而是作为一种处理方式，其结果可能影响量刑或治安处罚的轻重。
- 撤案：是指司法机关在侦查或审理过程中，发现不应追究犯罪嫌疑人刑事责任而作出的决定。撤案有严格的法定条件，不是所有案件都能通过调解实现撤案。
建议：在处理故意伤害案件时，应首先明确案件的性质和情节。对于轻微伤害案件，可以积极寻求调解以化解矛盾；对于构成犯罪的案件，则应依法进行侦查、起诉和审判，同时鼓励犯罪嫌疑人积极赔偿被害人损失、取得谅解，以期在量刑时获得从轻处罚。在整个过程中，如果遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。