对于拒绝配合调查取证的行为，行政机关可以依法进行行政处罚，具体流程和处罚措施如下：
一、行政处罚的法律依据
根据《中华人民共和国统计法》第四十一条的规定，作为统计调查对象的国家机关、企业事业单位或者其他组织，如果拒绝、阻碍统计调查、统计检查，将由县级以上人民政府统计机构责令改正，给予警告，并可以予以通报。对于企业事业单位或者其他组织，还可以并处五万元以下的罚款；情节严重的，并处五万元以上二十万元以下的罚款。对于个体工商户，则由县级以上人民政府统计机构责令改正，给予警告，并可以并处一万元以下的罚款。
二、行政处罚的具体流程
立案责任：
- 行政机关在发现拒绝、阻碍统计调查、统计检查的违法行为后，会进行审查，并决定是否立案。
调查责任：
- 对立案的案件，行政机关会指定专人负责，及时组织调查取证。
- 执法人员不少于两人，调查时会出示执法证件，听取当事人的辩解陈述并作记录。
- 执法人员会保守有关秘密，确保调查的公正性和合法性。
审查责任：
- 行政机关会审查案件调查报告，对案件的违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行全面审查，并提出处理意见。
告知责任：
- 在作出行政处罚决定前，行政机关会制作《行政处罚通知书》并送达当事人，告知其享有的陈述、申辩等权利。
- 如果符合听证规定，还会制作并送达《行政处罚听证告知书》。
决定责任：
- 行政机关会制作行政处罚决定书，载明行政处罚告知、当事人陈述申辩或者听证情况等内容。
送达责任：
- 行政处罚决定书会按法律规定的方式送达当事人，确保当事人知晓处罚决定。
三、当事人不配合行政执法的后果
- 如果当事人依然拒绝配合行政执法，行政机关有权依法展开调查取证工作，并通过各种合法手段固定相关证据。
- 当证据足够充分时，行政机关会依照法律规定作出行政处罚决定，并将该决定送达给当事人。
- 如果当事人在规定的期限内未履行处罚决定，行政机关可依法向法院申请强制执行。
四、法律建议
- 积极配合：当事人应积极配合行政机关的调查取证工作，避免不必要的法律后果。
- 了解权利：当事人有权了解行政处罚的依据、程序和自己的权利，如陈述、申辩等。
- 寻求法律帮助：如果当事人对行政处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
在实际操作中，每个案件的具体情况可能有所不同，因此行政机关在作出行政处罚决定时，会综合考虑案件的实际情况和法律规定。如果您或您所在的机构面临类似的问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。