发包人抗辩工程质量问题，法院未释明鉴定不构成程序违法。以下从不同角度为您详细分析：
一、法院未释明鉴定不违法的法律依据与理由
反诉的独立性：
- 发包人基于工程质量缺陷提出减少或拒付工程价款的请求，是相对于承包人请求支付工程价款而提出的独立诉讼请求。若发包人未提起反诉，法院通常不会主动释明或启动鉴定程序。这是因为反诉具有独立性，需要发包人明确提出并经过法院审查后才能决定是否受理。
举证责任：
- 发包人若主张工程质量存在问题，应承担举证责任。这包括提供初步证据证明工程质量可能不合格，以及在必要时申请质量鉴定。若发包人未充分举证或未提出反诉，法院有权结合案件实际情况，如工程主体结构质量经验收合格、发包人已接收使用工程等，决定是否准许质量鉴定。
程序公正与效率：
- 法院在审理案件时，需兼顾程序公正与效率。若发包人未提起反诉且未充分举证，法院未释明鉴定并不违反程序公正原则。同时，避免不必要的鉴定程序可以节省司法资源，提高审判效率。
二、发包人应如何正确主张工程质量问题
提起反诉：
- 若发包人认为工程质量存在问题，并希望以此为由减少或拒付工程价款，应在答辩期内提起反诉。反诉应明确诉讼请求、事实与理由，并附上相关证据材料。
充分举证：
- 发包人在提起反诉或抗辩时，应充分举证证明工程质量存在问题。这包括提供工程质量检测报告、专家意见等证据材料。若发包人未能充分举证，法院可能不予支持其主张。
申请质量鉴定：
- 在必要时，发包人可以向法院申请质量鉴定。但需注意，鉴定申请应在本诉或反诉的框架内提出，并符合法院对鉴定事项、鉴定机构等的要求。
三、法院处理此类案件的实践做法
结合实际情况判断：
- 法院在处理此类案件时，会结合工程主体结构质量经验收合格、发包人已接收使用工程等实际情况进行判断。若工程已验收合格或视同合格，法院可能不予准许发包人的质量鉴定申请。
引导当事人另行诉讼：
- 若发包人认为工程质量存在问题但未在本诉中提起反诉，法院可能会引导其另行提起诉讼。这样既可以保障发包人的诉讼权利，又可以避免本诉程序的拖延和复杂化。
四、法律后果与风险提示
败诉风险：
- 若发包人未提起反诉且未充分举证证明工程质量存在问题，法院可能不予支持其主张。这可能导致发包人面临败诉风险，需承担不利的法律后果。
另行诉讼的成本：
- 若发包人选择另行提起诉讼主张工程质量问题，需承担额外的诉讼成本和时间成本。因此，发包人应在综合考虑后做出决策。
建议：发包人在面对工程质量问题时，应明确自己的诉讼请求和事实依据，并在必要时提起反诉或申请质量鉴定。同时，发包人应充分了解法院处理此类案件的实践做法和法律后果，以便做出更为合理的决策。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。