核心结论：单位签订一式两份的合同，离职时合同的处理方式需结合合同性质、约定条款及法律规定综合判断，通常分为以下两种情况：

1. 劳动合同的离职处理

若合同为《劳动合同》，根据《劳动合同法》第五十条：

• 单位义务：用人单位应在解除/终止劳动合同时出具证明，并在15日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
• 合同返还：劳动者应将持有的劳动合同原件交还单位（若单位未收回，可自行保留但建议留存复印件）。
• 特殊条款：若合同中约定竞业限制、保密义务等，离职后仍需履行，单位可能需支付经济补偿。

风险提示：单位若扣押合同或拒绝出具离职证明，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求单位承担赔偿责任。

2. 普通民事合同的离职处理

若合同为普通民事合同（如合作协议、服务合同等）：

• 合同效力：离职不影响合同效力，双方仍需按约定履行义务（如支付款项、完成工作等）。
• 协商解除：可与单位协商终止合同，签订解除协议明确权利义务（如费用结算、违约责任等）。
• 单方解除：若合同约定解除权或符合法定解除条件（如不可抗力、对方违约），可依法解除并通知对方。

操作建议：

1. 核对合同条款，确认是否有关于离职的特殊约定；
2. 保留合同原件及履行证据（如工作记录、付款凭证等）；
3. 若发生纠纷，及时通过协商、调解或诉讼解决。

总结：离职时合同的处理需以合同性质和约定为依据，建议优先通过协商解决，必要时寻求法律帮助。如有具体问题，可直接向我咨询。