已取得预售许可证的在建工程，仍然可以进行在建工程抵押。以下从法律角度进行详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第三百九十五条的规定，债务人或者第三人有权处分的下列财产可以抵押，其中包括“正在建造的建筑物”。这一条款明确了在建工程可以作为抵押物，为在建工程抵押提供了法律基础。

二、预售与在建工程抵押的关系

1. 预售许可证的取得：预售许可证是房地产开发企业销售商品房的批准文件，其取得意味着开发商已经满足了预售商品房的相关条件，如交付全部土地使用权出让金、取得土地使用权证书、持有建设工程规划许可证等。

2. 在建工程抵押的独立性：在建工程抵押是开发商为了取得工程继续建造资金的贷款，以其合法方式取得的土地使用权连同在建工程的投入资产，以不转移占有的方式抵押给银行作为偿还贷款履行担保的行为。这一行为与预售许可证的取得并无直接冲突，因为两者涉及的是不同的法律关系和权利。

3. 重复抵押的禁止：虽然预售许可证的取得不影响在建工程抵押的合法性，但开发商在办理预售许可证后，不能再将土地进行抵押，因为这将构成重复抵押。然而，这并不影响在建工程本身的抵押，只要在建工程作为独立的抵押物，且符合抵押条件，就可以进行抵押。

三、在建工程抵押与预售的协调

1. 抵押权变更登记：当开发商需要预售已设定抵押权的在建工程时，应经抵押权人同意，并会同抵押人共同申请在建工程抵押权变更登记。通过减少可能出售的抵押物或增加别的在建工程抵押物，注销相应的抵押权内容，从而确保预售的顺利进行。

2. 预售与抵押的并行不悖：在建工程抵押和房屋预售之间并没有必然的限制关系。只要房屋建设符合相关法规规定的条件，开发单位就可以办理预售许可证。同时，为了解决后续建造资金，开发商也可以经和银行协商一致，以合法取得的土地使用权连同在建工程建成的资产设定抵押权。

四、法律建议

1. 谨慎设定抵押权：开发商在设定在建工程抵押权时，应充分考虑后续预售的可能性，避免因抵押权设定不当而影响预售。

2. 及时办理变更登记：当需要预售已设定抵押权的在建工程时，应及时办理抵押权变更登记，确保预售的合法性和顺利进行。

3. 遵守相关法规：开发商在进行在建工程抵押和预售时，应严格遵守相关法规规定，确保所有行为的合法性和有效性。

有问题可以直接向我咨询，我将结合你的具体情况，为你提供更详细的法律建议。