若您的专利配方被他人使用，且对方不承认而声称是使用自己的配方，这种行为是否违法，需要分情况讨论：

1. 若您拥有有效的专利权，且对方确实使用了您的专利配方：

   • 根据《中华人民共和国专利法》的相关规定，未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权。这意味着，如果对方确实使用了您的专利配方，无论其是否承认，都构成了对您专利权的侵犯。
   • 法律后果：您有权要求对方停止侵权行为，并可能要求其赔偿因侵权给您造成的损失。如果对方拒绝配合，您可以通过法律途径，如向法院提起诉讼，来维护自己的合法权益。

2. 若您无法证明对方使用了您的专利配方，或对方能证明其使用的是自己的配方：

   • 在这种情况下，由于缺乏直接的证据证明对方侵权，您可能难以通过法律手段追究对方的责任。专利权的保护依赖于明确的证据，如专利证书、配方对比、使用记录等。
   • 建议：如果您怀疑对方侵权，但缺乏直接证据，可以考虑收集更多间接证据，如市场调查、消费者反馈等，以支持您的主张。同时，也可以考虑与对方进行协商，寻求和解的可能性。

3. 关于对方声称使用自己配方的真实性：

   • 对方声称使用自己的配方，并不构成免责的理由。关键在于是否确实使用了您的专利配方。如果对方确实未使用您的配方，而是使用了自己的配方，那么其不构成侵权。但如果对方实际上使用了您的配方，却声称是自己的，这不仅是侵权行为，还可能涉及虚假陈述等法律问题。
   • 法律验证：在法律程序中，可以通过技术鉴定、专家证言等方式来验证对方是否确实使用了您的专利配方。

针对您的情况，我给出以下建议：

• 首先，确保您拥有有效的专利权，并保留好相关的专利证书和文件。
• 其次，如果怀疑对方侵权，尽量收集直接的证据，如配方对比、使用记录等。
• 如果缺乏直接证据，可以考虑收集间接证据，并与对方进行协商，寻求和解。
• 如果协商无果，且您有充分的理由相信对方侵权，可以通过法律途径来维护自己的权益。

在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，遵循法律程序，以维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。