加班超过36小时后辞职，劳动者是有权主张经济补偿的。以下是对此问题的详细分析：

一、经济补偿的法律依据

根据《劳动合同法》的相关规定，如果用人单位违反法律法规要求超时加班，劳动者有权随时解除劳动合同，并且用人单位应当支付经济补偿。经济补偿的标准是按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

二、经济补偿的计算方式

经济补偿的具体数额，可以根据以下公式进行计算：

• 经济补偿 = 工作年限 × 月工资

其中，月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。例如，如果劳动者在单位工作了3年，月工资为5000元，那么因单位违法加班辞职，经济补偿就是3年 × 5000元/年 = 15000元。

三、主张经济补偿的条件

1. 证据要求：劳动者需要有证据证明加班时间超过36小时，并且这是用人单位安排的。这可以通过加班通知、考勤记录等方式来证明。
2. 辞职程序：劳动者要符合法定的辞职程序，如提前通知用人单位等。一般来说，劳动者应提前30日以书面形式通知用人单位；若在试用期内，则提前3日通知即可。

四、争议解决途径

如果劳动者与用人单位就经济补偿问题产生争议，可以通过劳动仲裁等途径来解决。劳动仲裁一般分为四个步骤：当事人申请、审查受理、仲裁准备、仲裁审理。如果劳动仲裁结果不满意，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。

五、实际操作建议

1. 保留证据：劳动者应妥善保留与加班相关的证据，如加班通知、考勤记录等，以便在主张经济补偿时提供有力支持。
2. 与用人单位协商：在辞职前，劳动者可以尝试与用人单位进行协商，看是否能够达成一致意见，从而避免不必要的法律纠纷。
3. 寻求法律援助：如果劳动者在主张经济补偿过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更专业的法律建议和支持。

温馨提示：加班超过36小时后辞职，劳动者有权主张经济补偿。但在实际操作过程中，证据的收集以及辞职程序的合规性都至关重要。如果遇到用人单位不认可加班时长或在辞职过程中出现纠纷，劳动者应积极应对，通过合法途径维护自身权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。