公司一般是有权要求员工提供无犯罪证明并进行相关调查的，但具体是否会查以及如何查，取决于公司的政策、岗位需求以及法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、公司政策与岗位需求

1. 招聘环节：一些公司，尤其是涉及国家安全、金融、司法等特殊行业或岗位，在招聘时会明确要求应聘者提供无犯罪证明。这是为了确保员工背景清白，避免潜在风险，如内部盗窃、欺诈或泄露机密等行为。

2. 在职期间：对于某些特定岗位，如财务、高级管理等，公司可能会基于对自身利益保护和合规运营的考虑，定期或不定期要求员工提供无犯罪证明。这有助于公司及时了解员工的情况，确保业务正常运行和公共利益不受损害。

3. 特殊情况：当公司面临重大项目、合作或涉及敏感事务时，也可能会对相关员工进行背景审查，包括查看无犯罪证明。这是为了降低风险，确保项目的顺利进行和合作的成功。

二、法律法规的规定

1. 无犯罪证明的开具：根据我国相关法律的规定，用人单位需要无犯罪记录的，应该由当事人到公安机关申请开具。用人单位本身是无权直接查询员工犯罪记录的，但可以根据国家规定进行合法查询。

2. 犯罪记录的封存与查询：对于未成年人犯罪且被判处五年有期徒刑以下刑罚的，相关犯罪记录会被封存。封存的犯罪记录不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。

3. 合法调查的原则：公司在要求员工提供无犯罪证明或进行相关调查时，必须遵循合法、正当、必要的原则。不能随意侵犯员工的隐私权等合法权益。如果公司未经合法授权或超出必要范围进行调查，可能构成违法。

三、员工的权利与义务

1. 配合公司的合理要求：员工应配合公司的合理要求，如实提供相关证明。如果员工有犯罪记录，应视具体情况向公司说明。公司会根据实际情况综合判断是否继续录用或调整岗位等。

2. 了解用途和必要性：如果员工被公司要求提供无犯罪证明，有权了解其用途和必要性。这有助于员工判断公司的要求是否合理，并保护自己的合法权益。

3. 保护个人隐私：员工在提供无犯罪证明或接受相关调查时，应注意保护自己的个人隐私。如果发现公司未经合法授权或超出必要范围进行调查，可以及时向相关部门投诉或寻求法律帮助。

建议：

• 对于公司而言，在要求员工提供无犯罪证明或进行相关调查时，应确保遵循合法、正当、必要的原则，并保护员工的个人隐私。
• 对于员工而言，应配合公司的合理要求，并了解无犯罪证明的用途和必要性。如果发现公司行为不当，可以及时向相关部门投诉或寻求法律帮助。

如果有任何关于无犯罪证明或公司调查方面的法律问题，可以直接向我咨询。