雇员在履职过程中发生交通事故，垫付的部分赔偿款，能否向雇主追偿，需根据具体情况分析。

一. 一般情况：雇员因职务行为造成损害，由雇主承担赔偿责任

根据《民法典》第一千一百九十二条第一款的规定，个人之间形成劳务关系，提供劳务一方（即雇员）因劳务（即履职过程中）造成他人损害的，由接受劳务一方（即雇主）承担侵权责任。这意味着，在一般情况下，雇员因职务行为造成的交通事故损害，赔偿责任应由雇主承担。因此，雇员垫付的赔偿款，有权向雇主追偿。

• 例如，雇员在送货途中发生交通事故，导致他人受伤并垫付了部分赔偿款。由于这是雇员在履职过程中发生的，所以雇员有权向雇主追偿垫付的赔偿款。

二. 特殊情况：雇员存在故意或重大过失，雇主有权追偿

同样依据《民法典》第一千一百九十二条第一款的规定，如果雇员在履职过程中存在故意或者重大过失，导致交通事故的发生，雇主在承担侵权责任后，有权向有故意或者重大过失的雇员追偿。这意味着，在雇员存在故意或重大过失的情况下，雇员垫付的赔偿款，雇主可能不会全额追偿，甚至可能要求雇员承担部分或全部赔偿责任。

• 例如，雇员在醉酒后驾车送货，发生交通事故并垫付了赔偿款。由于醉酒驾车属于重大过失，雇主在承担赔偿责任后，有权向雇员追偿垫付的赔偿款，甚至可能要求雇员承担额外的赔偿责任。

综上所述，雇员在履职过程中发生交通事故，垫付的部分赔偿款能否向雇主追偿，取决于雇员是否存在故意或重大过失。如果雇员无过错或仅存在轻微过失，雇主应承担赔偿责任，雇员有权追偿垫付的赔偿款；如果雇员存在故意或重大过失，雇主有权根据具体情况向雇员追偿部分或全部赔偿款。如有进一步需要，您可以继续咨询我。