针对您提出的“签字的合同约定加班费低于最低工资标准”这一问题，我们需要从多个角度进行详细分析，以确保您的权益得到充分保障。

首先，我们要明确的是，约定加班费基数为最低工资标准并不一定合法。其合法性主要取决于该约定是否违反相关法律法规、是否损害劳动者权益以及是否符合劳动合同的公平原则。

法律依据分析

1. 《劳动法》和《劳动合同法》：这两部法律均明确规定了加班费的支付标准和计算方式。通常，加班费应基于劳动者的正常工作时间工资进行计算。这意味着，如果合同中约定的加班费计算基数（如最低工资标准）低于您的正常工作时间工资，那么这种约定可能存在问题。

2. 《工资支付暂行规定》：该规定指出，用人单位在安排劳动者加班时，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的相应倍数支付加班费。如果以最低工资标准为基数计算出的加班费低于法定最低加班费数额，那么这种约定显然是不合法的。

合法与不合法情形

合法情形：

• 若劳动合同中明确约定加班费计算基数为最低工资标准，且该约定是双方平等自愿、协商一致的结果，同时不违反法律强制性规定（即按照最低工资标准计算出的加班费不低于法定最低加班费数额），且未导致显失公平，那么这种约定在法律上是可接受的。但这种情况在实际操作中较为罕见，因为通常最低工资标准作为加班费基数会低于法定最低加班费要求。

不合法情形：

• 违反法律强制性规定：如果以最低工资标准为基数计算出的加班费低于以正常工作时间工资为基数计算得出的法定最低加班费数额，那么这种约定是不合法的。
• 显失公平：如果用人单位利用其优势地位或劳动者缺乏经验等情形，使劳动者在违背真实意思的情况下约定以最低工资标准作为加班费计算基数，且该约定明显对劳动者不利，那么这种约定可能因显失公平而被认定为无效。
• 低于正常工作时间工资：劳动合同或集体合同中约定的加班费计算基数不应低于劳动者的正常工作时间工资，否则将违反法律法规的规定。

实际操作建议

1. 核查合同条款：首先，您需要仔细核查劳动合同中关于加班费计算基数的条款，确认其是否违反了上述法律法规。

2. 与用人单位协商：如果发现合同条款存在问题，您可以尝试与用人单位进行协商，寻求修改合同条款或达成补充协议。

3. 寻求法律援助：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

4. 关注地区差异：不同地区的最低工资标准和加班费规定可能有所不同，因此在具体判断时需要结合当地的法律法规和政策文件。

综上所述，约定加班费基数为最低工资标准的合法性需根据具体情况来判断。在实际操作中，您应严格遵守相关法律法规，确保自己的合法权益得到保障。如果发现合同条款存在问题，请及时采取措施维护自己的权益。