小作坊给食品有限公司做代工是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法情形
小作坊具备合法资质且符合当地政策
- 小作坊需取得合法的经营资格，如食品生产加工小作坊登记证。不同地区对小作坊的监管政策存在差异，若当地政策允许小作坊进行委托加工，且小作坊满足资质要求，那么其给食品有限公司做代工是合法的。
- 例如，某些地区鼓励小作坊规范发展，允许其在一定条件下承接委托加工业务，以促进地方经济和小微企业发展。
食品有限公司具备相应资质且加工范围合规
- 接受委托的食品有限公司应具有合法的食品生产许可证，且该许可证需涵盖小作坊委托加工的食品类别。
- 双方需明确委托加工的食品品种、规格、质量标准等，并签订详细的委托加工合同，明确双方的权利和义务。合同内容应包括食品的质量标准、生产数量、加工费用、交货时间、知识产权归属及违约责任等关键条款。
- 食品有限公司在加工过程中应严格遵守食品安全相关的生产规范和标准，如《食品生产通用卫生规范》，确保产品质量和安全。
- 委托加工的食品在包装上需按照相关规定进行标注，包括委托方和受委托方的名称、地址、联系方式等信息，以确保产品的可追溯性。
二、违法情形
小作坊不具备合法资质或违反当地政策
- 若小作坊未取得合法的经营资格，如食品生产加工小作坊登记证，或者当地政策明确禁止小作坊进行委托加工，那么其给食品有限公司做代工就是违法的。
- 例如，根据《辽宁省食品安全条例》的规定，食品生产加工小作坊接受食品生产企业或者其他食品生产加工小作坊委托生产加工或者分装食品的，由县级以上食品药品监督管理部门没收违法所得和违法生产经营的食品、食品添加剂，并可以没收违法生产经营的工具、设备、原料等物品；违法生产经营的食品货值金额不足五千元的，并处五千元罚款；货值金额五千元以上的，并处货值金额五倍罚款；情节严重的，责令停产停业，直至吊销许可证。
食品有限公司不具备相应资质或加工范围不合规
- 若食品有限公司未取得合法的食品生产许可证，或者其许可证未涵盖小作坊委托加工的食品类别，那么其接受小作坊的委托进行加工就是违法的。
- 食品有限公司在加工过程中若未严格遵守食品安全相关的生产规范和标准，导致产品质量和安全不符合要求，也将承担相应的法律责任。
三、法律建议
小作坊方面
- 在进行委托加工前，应充分了解当地政策，确保自身具备合法经营资质。
- 与食品有限公司签订详细的委托加工合同，明确双方的权利和义务，以及产品质量标准和安全要求。
- 对食品有限公司的生产过程进行必要的监督和检查，确保加工质量符合约定标准。
食品有限公司方面
- 在接受委托加工前，应核实小作坊的合法资质和当地政策是否允许其进行委托加工。
- 确保自身具备相应的食品生产许可证，且许可证涵盖小作坊委托加工的食品类别。
- 严格按照合同约定的要求和生产规范进行加工，确保产品质量和安全符合要求。
若您是小作坊或食品有限公司的经营者，在进行委托加工业务时遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和解决方案。