结论：工厂自离时，是否需要签离职单以及扣多少工资，取决于工厂的规章制度、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。一般来说，自离时建议签署离职单以明确离职事实和双方责任；至于工资扣除，工厂不能随意扣除，需遵循法律法规和劳动合同的约定。
是否需要签离职单
从法律角度：
- 签署离职单是劳动者与用人单位之间就离职事宜达成一致的一种书面形式。虽然法律没有明确规定自离时必须签署离职单，但签署离职单有助于明确双方的责任和义务，避免后续纠纷。
- 如果工厂有明确的规章制度要求员工在离职时签署离职单，那么员工应当遵守这一规定。
从实际操作角度：
- 签署离职单可以确保劳动者和用人单位对离职时间、工资结算、工作交接等事项有明确的了解，减少不必要的误解和纠纷。
- 如果劳动者未签署离职单而擅自离职，可能会给用人单位带来管理上的困扰，甚至可能引发劳动争议。
工资扣除问题
法律法规规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位不得随意扣除劳动者的工资。工资扣除应当遵循合法、合理、公正的原则，并且需要与劳动者协商一致。
- 如果劳动者因自离给用人单位造成损失，用人单位可以要求劳动者承担赔偿责任，但赔偿金额应当合理，并且需要提供相应的证据。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中有关于自离时工资扣除的约定，那么双方应当按照约定执行。但需要注意的是，劳动合同中的约定不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果劳动合同中没有相关约定，那么用人单位不能随意扣除劳动者的工资。
实际操作建议：
- 劳动者在自离前，应当与用人单位就工资结算等事项进行协商，并尽量达成一致意见。
- 如果用人单位提出扣除工资的要求，劳动者可以要求用人单位提供相应的证据和合理的扣除依据。如果认为扣除不合理，劳动者可以通过法律途径维护自己的权益。
举例说明：假设某劳动者因个人原因自离，未签署离职单。工厂在结算工资时，以劳动者未提前通知为由扣除了一定比例的工资。在这种情况下，劳动者可以首先与工厂协商，要求工厂提供扣除工资的合理依据。如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：在自离时，建议劳动者与用人单位友好协商，并尽量签署离职单以明确双方的责任和义务。同时，劳动者也应当了解自己的权益和义务，避免在自离过程中遭受不必要的损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。