自动离职工厂扣工资一般是不合法的，但存在特定例外情形。以下是对此问题的详细分析：

一、自动离职工厂扣工资一般不合法

劳动者本身享有自主选择职业的权利，虽然自动离职可能未按照正常的离职程序进行，但这并不能成为工厂扣钱的正当借口。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。因此，在一般情况下，如果劳动者自动离职，工厂是无权扣减其工资的。

二、特定例外情形下工厂可扣工资

尽管自动离职工厂扣工资一般不合法，但也存在一些特定情形，使得工厂有权扣发工资：

1. 劳动者给工厂带来直接经济损失：

   • 如果因为劳动者自动离职给工厂带来了直接的经济损失，工厂是可以要求劳动者承担赔偿责任的。但这里有个规定，工厂扣钱不能超过劳动者当月工资的20%，而且扣完钱之后的工资不能比当地的最低工资标准还低。工厂需承担举证责任，证明损失的存在及与劳动者行为的因果关系。

2. 劳动者违反服务期约定：

   • 如果工厂为劳动者提供了专项培训费用，并与其订立了服务期协议，而劳动者在服务期内自动离职，违反了服务期约定，那么劳动者应当按照约定向工厂支付违约金。但违约金的数额不得超过工厂提供的培训费用，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。

3. 劳动者违反竞业限制约定：

   • 如果工厂与劳动者在劳动合同中约定了保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项，并约定了竞业限制条款，而劳动者离职后违反了竞业限制约定，如到与原单位有竞争关系的单位工作，那么工厂有权要求其支付违约金，并从工资中扣除相应金额。但同样，违约金数额需符合法律规定，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。

三、劳动者如何维权

如果工厂无故扣钱，劳动者应收集相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以证明自己的工资被无故扣减。然后，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

建议：作为劳动者，在自动离职前应尽可能与工厂进行沟通，说明离职原因并尽量完成工作交接，以减少不必要的纠纷。同时，也要了解自己的权益和维权途径，确保自身合法权益不受侵害。如果有任何法律问题或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。