自动离岗扣工资一般是不合法的，但存在特定例外情形。以下从不同角度进行详细分析：

一、自动离岗扣工资的一般原则

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保障劳动者合法权益的基本法律原则。因此，在一般情况下，如果劳动者自动离岗，用人单位不得以此为由扣发工资。

二、特定例外情形

尽管有上述一般原则，但在特定情况下，用人单位可能因劳动者的自动离岗行为而扣除部分工资。这主要发生在以下情形：

1. 劳动者自动离岗给用人单位造成经济损失：
   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条，若劳动者违反法律规定解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
   • 在这种情况下，用人单位可以要求劳动者赔偿经济损失，但赔偿需通过合法程序进行，不能直接从工资中扣除。
   • 扣除经济损失时，用人单位需遵守以下规定：每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

三、用人单位扣工资的合法程序与限制

1. 合法规章制度：

   • 用人单位若要在劳动者自动离岗时扣除工资，必须首先有合法的规章制度，明确规定擅自离岗属于违纪行为，并设定了相应的扣工资标准。
   • 该规章制度需经过民主程序制定，并向劳动者公示。

2. 证据支持：

   • 用人单位需提供明确证据证明劳动者的自动离岗行为给其造成了经济损失，以及损失的具体金额。

3. 扣除限制：

   • 即使存在经济损失，用人单位扣除工资时也需遵守上述关于扣除比例和最低工资标准的限制。

四、劳动者的维权途径

如果劳动者认为用人单位因自动离岗而扣发工资的行为不合法，可以采取以下维权途径：

1. 协商：

   • 首先尝试与用人单位进行友好协商，要求支付被扣除的工资。

2. 投诉：

   • 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由政府部门介入调查并责令用人单位限期支付。

3. 仲裁与诉讼：

   • 若问题仍未得到解决，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，甚至向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

五、总结与建议

自动离岗并不构成用人单位扣发工资的合法理由。用人单位应当依法为劳动者办理离职手续，并结清工资。若用人单位非法扣除劳动者工资，劳动者有多种途径可维护自己的合法权益。在处理此类纠纷时，应严格遵循法律法规，确保劳动者的合法权益得到充分保护。

建议：劳动者在自动离岗前，应尽可能与用人单位进行沟通，说明情况并尽量按照正常程序办理离职手续。若因特殊原因无法提前通知，也应在离岗后尽快与用人单位联系，协商解决工资结算等问题。同时，劳动者应保留好相关证据，如工资条、劳动合同等，以备不时之需。