工伤后分公司转入总公司，赔偿责任的承担主要取决于工伤发生时员工与哪家公司存在劳动关系，以及分公司是否具有独立法人资格。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动关系与赔偿责任
劳动关系确定：
- 工伤发生时，员工与哪家公司存在劳动关系是确定赔偿责任的关键。如果员工当时是与分公司签订的劳动合同，且分公司具有独立法人资格，那么赔偿责任通常由分公司承担。
- 如果分公司不具有独立法人资格，其法律责任通常由总公司承担。在这种情况下，即使员工是与分公司签订的劳动合同，赔偿责任也可能最终由总公司来承担。
分公司具有独立法人资格的情况：
- 如果分公司具有独立法人资格，那么它应当独立承担民事责任，包括工伤赔偿责任。这意味着，如果员工在分公司工作期间发生工伤，且分公司具有独立法人资格，那么员工应当向分公司主张工伤赔偿。
分公司不具有独立法人资格的情况：
- 如果分公司不具有独立法人资格，那么它的民事责任应当由总公司承担。在这种情况下，如果员工在分公司工作期间发生工伤，即使劳动合同是与分公司签订的，员工也可以向总公司主张工伤赔偿。
二、实际操作中的注意事项
查看劳动合同：
- 员工应当首先查看自己的劳动合同，确定是与哪家公司签订的。这有助于确定最初的赔偿责任主体。
了解分公司法人资格：
- 员工需要了解分公司是否具有独立法人资格。这可以通过查询工商登记信息或咨询专业律师来确认。
及时申请工伤认定：
- 无论赔偿责任主体是分公司还是总公司，员工都应当及时申请工伤认定。这是获得工伤赔偿的前提条件。
保留相关证据：
- 员工应当保留与工伤相关的所有证据，包括医疗记录、工伤事故报告、劳动合同等。这些证据在主张工伤赔偿时非常重要。
三、法律建议
- 如果分公司具有独立法人资格：员工可以直接向分公司主张工伤赔偿。如果分公司拒绝赔偿或无法联系到分公司，员工可以考虑向法院提起诉讼。
- 如果分公司不具有独立法人资格：员工应当向总公司主张工伤赔偿。在这种情况下，总公司作为分公司的上级单位，应当承担分公司的民事责任。
- 在不确定的情况下：员工可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。律师可以根据员工的实际情况，提供针对性的法律指导和帮助。
有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，提供更详细的法律建议。