针对您提出的“公司员工怀孕不能好好上班公司怎么办”的问题，这是一个涉及劳动法律和员工权益的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《女职工劳动保护特别规定》以及《劳动合同法》的相关规定，孕期女职工享有特定的权益保护。这包括但不限于：用人单位不得降低孕期女职工的工资，以及不能随意辞退孕期女职工。这些规定旨在保障孕期女职工的经济收入和工作稳定性。

当员工怀孕后出现工作表现不佳的情况时，公司应采取以下步骤来处理：

1. 沟通交流：

   • 公司应首先与员工进行深入的沟通交流，了解员工的具体状况。
   • 仔细排查是否是因为怀孕而给工作带来了困难，如身体不适、孕期反应等影响工作效率的因素。

2. 合理调整：

   • 如果员工确实是由于身体原因而无法正常开展工作，公司可以根据员工的实际情况，合理地调整工作岗位或者工作内容。
   • 在进行调整时，必须确保调整后的工作既符合法律法规的要求，也不违背劳动合同的约定，以充分保障员工的合法权益。

3. 依据规章制度处理：

   • 如果员工没有正当理由拒绝公司的工作调整，或者仍然继续消极怠工，公司可以依据本单位的规章制度来进行处理。
   • 在处理过程中，公司必须注意程序的合法性，如事先将本单位规章制度的内容明确告知员工，让员工清楚知晓相关规定。
   • 同时，要给予员工申辩的机会，让员工有机会解释自己的行为和情况。

4. 严重违纪处理：

   • 如果员工违反了严重违纪规定，公司则有权解除劳动合同。
   • 但在做出解除劳动合同的决定之前，公司必须保留好相关的证据，如员工消极怠工的记录、拒绝调整岗位的书面证明等，以确保解除劳动合同的行为是合法有效的。

5. 特殊情况处理：

   • 如果公司不知情的情况下辞退了怀孕女员工，公司应恢复与员工的劳动关系，并续签劳动合同至哺乳期结束。
   • 如果员工选择接受赔偿金，则需要退还给公司已支付的赔偿金（如果公司愿意继续履行合同的话），或者员工可以选择要求公司继续履行劳动合同。

综上所述，公司在处理怀孕员工工作表现不佳的问题时，应遵循法律法规，尊重员工权益，通过沟通交流、合理调整、依据规章制度处理以及特殊情况处理等方式，来妥善解决这一问题。希望这些解答能对您有所帮助。