交通肇事案件中，检察院不起诉并不意味着纪委会自动进行处罚，两者是独立的体系，处理方式和依据各不相同。以下是对此问题的详细分析：

一、检察院不起诉的含义及后果

检察院不起诉，通常意味着在审查起诉阶段，检察院认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，因此决定不向法院提起公诉。这种情况下，犯罪嫌疑人通常不会面临刑事审判和刑罚。

二、纪委的职责及处罚依据

纪委，即党的纪律检查机关，主要负责监督党的组织和党员执行党的路线、方针、政策的情况，查处违反党纪的行为。纪委的处罚依据是党的纪律，如《中国共产党纪律处分条例》等，与检察院的刑事起诉和法院的刑事审判是独立的两个体系。

三、检察院不起诉与纪委处罚的关系

1. 独立性：检察院的不起诉决定是基于刑事法律的规定和证据情况作出的，而纪委的处罚是基于党的纪律和规定。两者在决定是否进行处罚时，依据的法律和规定不同，因此检察院的不起诉并不直接影响纪委是否进行处罚。

2. 可能的情况：

   • 如果交通肇事行为同时违反了党的纪律，如公职人员利用职务之便违反交通法规造成严重后果，即使检察院不起诉，纪委也可能根据党的纪律进行处罚。
   • 如果交通肇事行为仅涉及刑事责任，且检察院认为不构成犯罪或情节轻微不起诉，那么纪委通常不会因此进行处罚，除非该行为同时违反了党的其他纪律规定。

四、建议与注意事项

1. 了解具体案情：要准确判断检察院不起诉后纪委是否会处罚，需要详细了解案情，包括交通肇事的具体情况、是否涉及公职人员、是否违反了党的纪律等。

2. 咨询专业人士：由于法律问题复杂多变，且涉及多个法律体系和规定，建议咨询专业律师或法律顾问，以获取更准确、全面的法律意见。

3. 遵守法律法规：无论是普通公民还是公职人员，都应严格遵守交通法规和党的纪律，避免发生交通肇事等违法行为，以免面临法律和纪律的双重处罚。

如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更详细、准确的法律意见。