企业实施违法行为后被吸收合并，其违法责任原则上仍由合并后存续的企业或新设的企业承担。具体责任承担方式需结合违法行为的性质、合并类型及法律规定综合判断，以下是详细分析：

1. 责任承担的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第六十七条：“法人合并的，其权利和义务由合并后的法人享有和承担。”

• 吸收合并：被吸收方解散，其债权债务由吸收方承继；
  
• 新设合并：原法人全部解散，债权债务由新设法人承继。
  违法责任作为债务的一种，同样适用上述规则。例如，若企业因环境污染被处罚，合并后企业需继续履行罚款缴纳、整改等义务。

2. 责任承担的例外情形

若违法行为具有人身专属性（如特定人员的刑事责任），则合并后企业不承担该部分责任。例如：

• 刑事责任：直接责任人（如法定代表人、直接操作人员）可能被追究刑事责任，但合并后企业本身不承担刑事责任；
  
• 行政处罚中的“双罚制”：若行政处罚同时针对企业和个人（如企业罚款+负责人罚款），合并后企业需承担企业部分的罚款，但个人责任不转移。

3. 实务中的责任划分要点

• 违法行为时间点：
  
  • 若违法行为发生在合并前，合并后企业需承担责任；
    
  • 若发生在合并后，由合并后企业直接承担。
    
• 合并协议约定：
  合并双方可在协议中约定债务承担方式，但不得对抗善意第三人（如政府监管部门）。例如，若协议约定“某笔违法罚款由被吸收方原股东承担”，但监管部门仍可要求合并后企业履行。
  
• 主观过错影响：
  若合并后企业能证明对违法行为不知情且无过错（如尽职调查未发现），可能减轻责任，但实践中认定难度较高。

4. 实务建议

• 合并前尽职调查：重点核查目标企业是否存在未了结的违法事项，评估潜在责任风险；
  
• 协议条款设计：在合并协议中明确违法责任承担主体，并要求原股东提供担保；
  
• 合规整改：合并后及时对被吸收企业的违法行为进行整改，避免责任扩大。

如有具体案件或合并方案，可进一步提供细节，我将为您分析责任承担的具体路径。