针对您提出的“和企业签了实习协议但是实习手册章不在企业盖章可以吗”这一问题，我们需要从实习协议的法律效力以及实习手册盖章的目的和要求两个方面来进行分析。

首先，关于实习协议的法律效力。实习协议是您与企业之间就实习事宜达成的一致意见，它明确了双方的权利和义务。根据一般的法律原则，只要协议内容合法、双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议就是有效的。在签订实习协议时，通常需要双方签字或盖章以确认协议的效力。如果企业已经以某种形式（如签字、合同章等）确认了协议内容，那么从法律上讲，该协议已经具备了一定的法律效力。

接下来，我们来看实习手册盖章的问题。实习手册通常是学校或企业为了规范实习过程、记录实习情况而制定的一种文档。关于实习手册是否需要企业盖章，这主要取决于学校或企业的具体要求。如果学校或企业明确要求实习手册必须加盖企业公章，那么您就需要按照这一要求来操作。因为公章是企业法人权利的象征，加盖公章可以视为企业对实习手册内容的认可和确认。

然而，如果学校或企业并没有明确要求实习手册必须加盖企业公章，而是允许使用其他形式的确认（如合同章、部门章或负责人签字等），那么您就可以根据实际情况来选择合适的确认方式。在这种情况下，即使实习手册上没有加盖企业公章，也不会影响其实习记录的合法性和有效性。

综合以上分析，我的建议是：

1. 查看实习协议和实习手册的具体要求：首先，您需要仔细阅读实习协议和实习手册的相关条款，了解学校或企业对实习手册盖章的具体要求。

2. 与企业沟通确认：如果实习手册上没有明确要求加盖企业公章，但您对此存在疑虑或不确定，那么您可以与企业进行沟通确认，了解企业对此的看法和要求。

3. 遵循学校或企业的规定：无论实习手册是否需要加盖企业公章，您都应该遵循学校或企业的相关规定和要求来操作。如果学校或企业明确要求加盖公章，那么您就需要积极与企业协商解决盖章问题。

总之，实习手册是否需要加盖企业公章主要取决于学校或企业的具体要求。在处理这一问题时，您需要仔细阅读相关条款、与企业沟通确认，并遵循学校或企业的规定来操作。