在刑事自诉案件审理过程中，若发现主犯另有其人，法院会根据案件具体情况采取相应措施，核心处理方式如下：

1. 法院依职权追加被告人或变更起诉

• 法律依据：根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，法院在审理中发现案件事实与自诉人指控不符（如遗漏主犯），可依职权通知自诉人补充起诉，或直接追加被告人参与诉讼。
• 操作方式：
  • 若主犯身份明确，法院会要求自诉人补充指控材料（如证据、起诉状），或直接裁定追加被告人。
  • 若自诉人拒绝补充或无法补充，法院可能以“事实不清、证据不足”为由驳回起诉，或建议自诉人撤回起诉后重新起诉。
• 关键点：法院此举旨在保障被告人的辩护权及案件的公正审理，避免因遗漏关键犯罪人导致判决错误。

2. 自诉人可申请变更或补充起诉

• 自诉人权利：若自诉人在审理中发现主犯另有其人，可主动向法院提交《补充起诉申请书》，附上新证据（如共犯供述、监控录像、转账记录等），要求追加被告人。
• 法院审查：法院会对补充材料进行审查，若证据充分，会通知新被告人参与诉讼；若证据不足，可能要求自诉人进一步补证或驳回申请。
• 风险提示：若自诉人未及时申请补充起诉，可能导致已起诉部分被告人承担超出其责任范围的刑罚，或因证据链不完整被判无罪。

3. 案件可能转为公诉案件（若涉及严重犯罪）

• 转化情形：根据《刑事诉讼法》第19条，若案件在审理中发现主犯涉嫌危害国家安全、恐怖活动、黑社会性质组织等严重犯罪，法院应将案件移送公安机关立案侦查，自诉程序终止。
• 操作流程：法院会裁定中止审理，将案件材料及证据移送同级检察院，由检察院决定是否提起公诉。
• 例外：若自诉案件仅涉及普通侵犯人身、财产权利犯罪（如故意伤害、侮辱诽谤），则不会因发现主犯而转为公诉。

4. 对已判决部分的影响及救济途径

• 若案件已部分判决：若法院已对部分被告人作出判决，后发现主犯另有其人，可通过审判监督程序（再审）纠正错误判决。
• 再审启动主体：
  • 法院依职权启动（如发现新证据）；
  • 当事人（自诉人或被告人）向上一级法院申诉，经审查后决定是否再审。
• 再审结果：可能撤销原判，发回重审或直接改判，确保所有共犯按责任大小承担刑罚。

实务建议

1. 自诉人应全面收集证据：在起诉前，通过律师调查、申请法院调取证据等方式，尽可能固定所有共犯的犯罪证据，避免遗漏。
2. 及时与法院沟通：审理中发现主犯线索，应立即书面申请补充起诉，防止因程序拖延导致权利受损。
3. 关注案件性质变化：若案件可能涉及严重犯罪，需做好转为公诉的准备，配合公安机关调查。

如有具体案件细节（如罪名、证据情况），可直接向我咨询，我会结合案情提供进一步分析。