用人单位与员工签订的劳动合同中，约定每周工作时间超过40小时的情况，需根据具体情形来判断其合法性。以下是从不同角度进行的分析：

1. 标准工时制下的合法性：

   • 根据《劳动法》及相关规定，标准工时制下，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过40小时。这是法律对劳动者工作时间的基本保护。
   • 若劳动合同中约定每周工作时间超过40小时，且未依法安排补休或支付加班费，则该约定违法。因为这违反了法律对劳动者工作时间的限制，损害了劳动者的休息权。

2. 综合计算工时制与不定时工时制下的合法性：

   • 对于实行综合计算工时工作制或不定时工作制的岗位，用人单位与员工可以协商确定具体的工作时间安排。
   • 在综合计算工时制下，只要在一个综合计算周期内（如周、月、季、年）的总工作时间不超过法定标准工作时间，且平均每周工作时间不超过40小时，则每周超过40小时的部分可以视为合法。但需注意，超出部分应依法支付加班费或安排补休。
   • 在不定时工作制下，由于劳动者的工作时间不受固定工时限制，因此劳动合同中约定每周工作时间超过40小时并不必然违法。但同样，超出部分若涉及加班，应依法支付加班费。

3. 双方协商一致下的合法性：

   • 即使在不实行综合计算工时制或不定时工作制的岗位上，如果用人单位与员工通过协商一致，且员工自愿接受每周超过40小时的工作时间，并明确约定了加班费或补休等补偿措施，该约定在形式上可能被视为合法。但需注意，这种协商一致不得违反法律的强制性规定，如不得损害员工的健康权、休息权等基本权益。
   • 然而，从实践角度来看，即使双方协商一致，超出法定工作时间的工作安排也可能面临劳动监察部门的审查。如果审查发现该安排损害了员工的合法权益，劳动监察部门有权要求用人单位进行整改。

4. 特殊情况下的合法性：

   • 在某些特殊行业或岗位上，如医疗、交通、能源等，由于工作性质的特殊性，可能需要员工在周末或节假日工作。在这种情况下，用人单位与员工签订的劳动合同中约定每周工作时间超过40小时可能是合法的，但需依法支付加班费或安排补休。

法律建议：

• 用人单位在签订劳动合同时，应严格遵守《劳动法》及相关规定，确保劳动合同中的工作时间安排合法合规。
• 员工在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工作时间、加班费、补休等内容的约定，确保自己的合法权益得到保障。
• 如果用人单位与员工就工作时间安排发生争议，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以依法向劳动争议调解委员会申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

可能后果：

• 如果用人单位违反法律规定，与员工签订每周工作时间超过40小时且未依法安排补休或支付加班费的劳动合同，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
• 员工也有权依法维护自己的合法权益，如向劳动监察部门投诉、申请劳动争议仲裁或提起诉讼等。