结论：公司全额扣员工社保一般不合法，但存在特殊情况需具体分析。以下从不同角度展开说明：

1. 常规情况：公司全额扣员工社保不合法

根据《社会保险法》及《工资支付暂行规定》，社保费用由用人单位和员工共同承担，具体比例如下：

• 养老保险：单位缴纳比例约16%（各地有差异），个人缴纳8%；
• 医疗保险：单位缴纳比例约8%-10%，个人缴纳2%；
• 失业保险：单位缴纳约0.5%-2%，个人缴纳0.5%；
• 工伤保险、生育保险：由单位全额缴纳，个人不承担。

若公司直接从员工工资中扣除全部社保费用（包括单位应缴部分），属于违法行为。员工有权要求公司返还多扣款项，并可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 特殊情况：需结合合同与实际履行判断

• 员工自愿书面同意：若员工签署书面协议，明确同意公司从其工资中代扣单位应缴部分（如因公司资金困难等特殊原因），且协议不违反法律强制性规定，可能被认定为合法。但此类协议需严格符合《劳动合同法》中关于“工资扣除”的限额规定（如每月扣除不得超过工资的20%）。
• 公司已实际缴纳单位部分：若公司仅在工资计算时“预扣”全部费用，但后续通过其他账户补缴了单位应缴部分，需结合工资条、社保缴费记录等证据判断是否合法。若员工能证明公司未实际缴纳单位部分，仍可主张权利。

3. 员工维权建议

• 第一步：固定证据
  保留工资条、银行流水、社保缴费记录、劳动合同等材料，证明公司实际扣除的金额及社保缴纳情况。
• 第二步：协商或投诉
  与公司协商要求返还多扣款项；若协商无果，可向当地社保局或劳动监察大队投诉（需在知道权益被侵害之日起2年内提出）。
• 第三步：申请仲裁
  若投诉未果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张公司返还违法扣除的款项及可能的经济补偿。

提示：社保缴纳比例因地区而异，建议先通过当地社保局官网或12333热线查询具体标准。若遇到复杂情况（如公司以“补贴”形式变相转移成本），可直接向我提供细节，我会进一步分析。